72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1163 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_1163  hypothetical protein  100 
 
 
103 aa  211  2.9999999999999995e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0556708  normal  0.177058 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1917  hypothetical protein  58.95 
 
 
117 aa  121  4e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0606069  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2897  hypothetical protein  57.61 
 
 
115 aa  112  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.359855 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0326  hypothetical protein  52.69 
 
 
117 aa  105  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.402974  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0312  hypothetical protein  52.69 
 
 
117 aa  104  3e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4536  protein of unknown function DUF952  52.17 
 
 
115 aa  102  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.359065  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0548  hypothetical protein  48.94 
 
 
116 aa  101  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.303281  normal  0.0576469 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1468  hypothetical protein  50.53 
 
 
120 aa  101  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.291204  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3257  hypothetical protein  51.65 
 
 
115 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.55891  normal  0.0949629 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4623  hypothetical protein  48.42 
 
 
114 aa  99.8  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0864  protein of unknown function DUF952  47.37 
 
 
114 aa  98.2  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.781943  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0517  hypothetical protein  42.42 
 
 
119 aa  98.2  3e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.63367 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0756  hypothetical protein  45.83 
 
 
114 aa  97.1  8e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.824326  normal  0.356422 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0405  hypothetical protein  48.39 
 
 
116 aa  96.7  9e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0787  hypothetical protein  44.79 
 
 
114 aa  95.5  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.732307 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0556  hypothetical protein  44.68 
 
 
131 aa  94.7  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2616  hypothetical protein  47.78 
 
 
112 aa  94  6e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0436  hypothetical protein  46.07 
 
 
118 aa  94  7e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0956  hypothetical protein  47.78 
 
 
112 aa  93.6  8e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0792  hypothetical protein  45.74 
 
 
114 aa  93.6  8e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00855972 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0192  protein of unknown function DUF952  42.27 
 
 
117 aa  93.6  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.883458 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0093  hypothetical protein  43.82 
 
 
115 aa  92.4  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0162  hypothetical protein  45.65 
 
 
115 aa  92  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.965417  normal  0.834789 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0465  hypothetical protein  43.62 
 
 
114 aa  91.7  3e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0221  protein of unknown function DUF952  44.33 
 
 
117 aa  91.7  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.808162 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3013  hypothetical protein  46.67 
 
 
112 aa  91.7  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.634582  normal  0.256865 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2383  protein of unknown function DUF952  45.65 
 
 
116 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2107  hypothetical protein  45.65 
 
 
116 aa  90.9  5e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.808396  normal  0.0238058 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2059  protein of unknown function DUF952  48.31 
 
 
116 aa  90.9  6e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0585  hypothetical protein  46.67 
 
 
143 aa  90.1  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1067  hypothetical protein  44.09 
 
 
117 aa  88.6  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.201383 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2883  hypothetical protein  47.31 
 
 
124 aa  88.6  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.646253  normal  0.212709 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0848  protein of unknown function DUF952  48.81 
 
 
111 aa  85.1  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0194191  normal  0.118784 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3797  protein of unknown function DUF952  41.49 
 
 
128 aa  85.1  3e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.899474 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2962  hypothetical protein  48.81 
 
 
111 aa  79.3  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0105534 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1549  hypothetical protein  45.56 
 
 
112 aa  76.6  0.00000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0531492  normal  0.447397 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0513  hypothetical protein  34.74 
 
 
121 aa  72  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.11264  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0387  hypothetical protein  36.26 
 
 
114 aa  71.2  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.580664  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2456  hypothetical protein  33.65 
 
 
118 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.397469 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5199  protein of unknown function DUF952  39.73 
 
 
98 aa  59.7  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.157492  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3943  hypothetical protein  37.68 
 
 
125 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2563  protein of unknown function DUF952  30.91 
 
 
120 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1396  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.74 
 
 
323 aa  58.5  0.00000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2171  hypothetical protein  33.67 
 
 
142 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0419076  hitchhiker  0.00150651 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2228  hypothetical protein  33.67 
 
 
142 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2182  hypothetical protein  33.67 
 
 
142 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0952783  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27941  glutathione S-transferase N terminus protein  33.33 
 
 
333 aa  57.8  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3543  protein of unknown function DUF952  30 
 
 
120 aa  57.8  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12720  hypothetical protein  32 
 
 
129 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0861  hypothetical protein  42.65 
 
 
114 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.333233 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3672  hypothetical protein  32.61 
 
 
115 aa  55.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2472  hypothetical protein  31.18 
 
 
106 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0467967  normal  0.531693 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1636  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.38 
 
 
323 aa  52.4  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2860  hypothetical protein  26.37 
 
 
106 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000466115  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4589  protein of unknown function DUF952  31.68 
 
 
114 aa  48.9  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18352  hitchhiker  0.00537497 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1066  protein of unknown function DUF952  31 
 
 
116 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.210696 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2614  hypothetical protein  26.26 
 
 
110 aa  48.5  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0019859  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3986  protein of unknown function DUF952  32.39 
 
 
374 aa  48.5  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00940  hypothetical protein  30.53 
 
 
117 aa  47  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2838  hypothetical protein  28.36 
 
 
107 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000244787  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2538  hypothetical protein  29.41 
 
 
112 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.070285  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1680  protein of unknown function DUF952  42.42 
 
 
103 aa  45.4  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.569653  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3868  hypothetical protein  34.18 
 
 
124 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0949511  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1916  hypothetical protein  24.73 
 
 
114 aa  45.1  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0102  hypothetical protein  28.28 
 
 
115 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2172  hypothetical protein  31.46 
 
 
117 aa  43.9  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2820  hypothetical protein  25 
 
 
110 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000165343 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2813  hypothetical protein  25 
 
 
110 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0272117  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2571  hypothetical protein  25 
 
 
112 aa  43.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000205599  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2622  hypothetical protein  25 
 
 
112 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0382701  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4550  hypothetical protein  28.43 
 
 
115 aa  42.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1633  protein of unknown function DUF952  37.7 
 
 
120 aa  40.4  0.009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0372909 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>