70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1917 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_1917  hypothetical protein  100 
 
 
117 aa  237  4e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0606069  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2897  hypothetical protein  67.57 
 
 
115 aa  154  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.359855 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1163  hypothetical protein  58.95 
 
 
103 aa  121  3e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0556708  normal  0.177058 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4536  protein of unknown function DUF952  54.63 
 
 
115 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.359065  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0548  hypothetical protein  50.93 
 
 
116 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.303281  normal  0.0576469 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3257  hypothetical protein  51.85 
 
 
115 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.55891  normal  0.0949629 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1468  hypothetical protein  47.37 
 
 
120 aa  106  9.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.291204  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2059  protein of unknown function DUF952  50 
 
 
116 aa  105  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0436  hypothetical protein  49.07 
 
 
118 aa  105  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0326  hypothetical protein  50.93 
 
 
117 aa  105  3e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.402974  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0093  hypothetical protein  48.62 
 
 
115 aa  104  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0585  hypothetical protein  50.94 
 
 
143 aa  103  5e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0162  hypothetical protein  48.11 
 
 
115 aa  104  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.965417  normal  0.834789 
 
 
-
 
NC_004310  BR0312  hypothetical protein  50.93 
 
 
117 aa  103  6e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2383  protein of unknown function DUF952  48.15 
 
 
116 aa  103  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0405  hypothetical protein  46.3 
 
 
116 aa  103  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2107  hypothetical protein  48.15 
 
 
116 aa  102  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.808396  normal  0.0238058 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0848  protein of unknown function DUF952  58.14 
 
 
111 aa  100  5e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0194191  normal  0.118784 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0192  protein of unknown function DUF952  45.61 
 
 
117 aa  97.1  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.883458 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0221  protein of unknown function DUF952  46.49 
 
 
117 aa  97.1  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.808162 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0756  hypothetical protein  44.34 
 
 
114 aa  95.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.824326  normal  0.356422 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0517  hypothetical protein  42.06 
 
 
119 aa  94  6e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.63367 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2883  hypothetical protein  46.88 
 
 
124 aa  92.8  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.646253  normal  0.212709 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2616  hypothetical protein  48.39 
 
 
112 aa  92.8  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4623  hypothetical protein  45.1 
 
 
114 aa  92.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0956  hypothetical protein  48.39 
 
 
112 aa  92  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0864  protein of unknown function DUF952  42.45 
 
 
114 aa  91.3  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.781943  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3013  hypothetical protein  47.31 
 
 
112 aa  91.3  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.634582  normal  0.256865 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0792  hypothetical protein  42.45 
 
 
114 aa  89  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00855972 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0556  hypothetical protein  42.45 
 
 
131 aa  88.6  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3797  protein of unknown function DUF952  42.72 
 
 
128 aa  87.8  5e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.899474 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1067  hypothetical protein  43.69 
 
 
117 aa  86.7  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.201383 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2962  hypothetical protein  50.53 
 
 
111 aa  86.7  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0105534 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1549  hypothetical protein  47.71 
 
 
112 aa  86.7  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0531492  normal  0.447397 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0465  hypothetical protein  40.57 
 
 
114 aa  84.3  5e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0787  hypothetical protein  39.62 
 
 
114 aa  84  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.732307 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0387  hypothetical protein  43.56 
 
 
114 aa  84  6e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.580664  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0513  hypothetical protein  36.46 
 
 
121 aa  71.6  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.11264  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0861  hypothetical protein  40.74 
 
 
114 aa  60.8  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.333233 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2456  hypothetical protein  31.58 
 
 
118 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.397469 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2228  hypothetical protein  31.58 
 
 
142 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2182  hypothetical protein  31.58 
 
 
142 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0952783  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2171  hypothetical protein  31.58 
 
 
142 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0419076  hitchhiker  0.00150651 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00940  hypothetical protein  34.21 
 
 
117 aa  54.7  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2472  hypothetical protein  32.43 
 
 
106 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0467967  normal  0.531693 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2614  hypothetical protein  31.25 
 
 
110 aa  52.4  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0019859  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2860  hypothetical protein  34.38 
 
 
106 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000466115  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1916  hypothetical protein  32.5 
 
 
114 aa  51.6  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2838  hypothetical protein  28.75 
 
 
107 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000244787  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1066  protein of unknown function DUF952  32.94 
 
 
116 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.210696 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2571  hypothetical protein  29.27 
 
 
112 aa  50.4  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000205599  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2622  hypothetical protein  29.27 
 
 
112 aa  50.4  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0382701  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2820  hypothetical protein  29.27 
 
 
110 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000165343 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2813  hypothetical protein  29.27 
 
 
110 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0272117  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3943  hypothetical protein  32.91 
 
 
125 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3986  protein of unknown function DUF952  34.31 
 
 
374 aa  49.3  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2970  hypothetical protein  28.3 
 
 
111 aa  48.9  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12720  hypothetical protein  39.19 
 
 
129 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5199  protein of unknown function DUF952  31.52 
 
 
98 aa  48.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.157492  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3868  hypothetical protein  27.37 
 
 
124 aa  47.4  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0949511  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2563  protein of unknown function DUF952  27.45 
 
 
120 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2538  hypothetical protein  26.83 
 
 
112 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.070285  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3543  protein of unknown function DUF952  28.43 
 
 
120 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4589  protein of unknown function DUF952  29.87 
 
 
114 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18352  hitchhiker  0.00537497 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3672  hypothetical protein  28.75 
 
 
115 aa  42.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1636  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.51 
 
 
323 aa  42  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27941  glutathione S-transferase N terminus protein  28.12 
 
 
333 aa  41.6  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2172  hypothetical protein  30.53 
 
 
117 aa  41.6  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0080  protein of unknown function DUF952  29.63 
 
 
108 aa  40.4  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4808  protein of unknown function DUF985  32.41 
 
 
286 aa  40  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>