20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0395 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0395  hypothetical protein  100 
 
 		 289 aa  573  1.0000000000000001e-162  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.361684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2309  hypothetical protein  34.52 
 
 		 241 aa  126  5e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.316951 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2929  protein of unknown function DUF955  33.06 
 
 		 235 aa  106  4e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.316011 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0609  protein of unknown function DUF955  27.66 
 
 		 454 aa  48.5  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0947915  normal  0.804601 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1191  hypothetical protein  32.46 
 
 		 177 aa  47  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.000518947  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1588  hypothetical protein  34.29 
 
 		 390 aa  46.6  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266201  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3235  protein of unknown function DUF955  31.52 
 
 		 270 aa  46.6  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.554214  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0412  hypothetical protein  32.5 
 
 		 188 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0309  hypothetical protein  30.53 
 
 		 392 aa  45.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1309  hypothetical protein  35.16 
 
 		 284 aa  45.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.584713  normal  0.697402 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0050  protein of unknown function DUF955  35.87 
 
 		 160 aa  43.9  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000733414 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0527  hypothetical protein  30.83 
 
 		 294 aa  43.9  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.641054 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3552  hypothetical protein  41.27 
 
 		 385 aa  43.5  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0204  diaminopimelate epimerase  25.98 
 
 		 246 aa  43.5  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4623  hypothetical protein  36.36 
 
 		 255 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4601  hypothetical protein  36.36 
 
 		 255 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0882  hypothetical protein  36.04 
 
 		 182 aa  42.7  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.956838 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0389  hypothetical protein  28.91 
 
 		 393 aa  42.7  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0725053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1348  hypothetical protein  29.17 
 
 		 142 aa  42.4  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2449  protein of unknown function DUF955  26.83 
 
 		 165 aa  42.4  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>