20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5200 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5200  hypothetical protein  100 
 
 		 172 aa  350  4e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.540164 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2789  hypothetical protein  39.05 
 
 		 184 aa  82  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4096  hypothetical protein  31.29 
 
 		 164 aa  68.6  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.3551  normal  0.141036 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1465  50S ribosomal protein L21  35.96 
 
 		 208 aa  63.2  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02720  50S ribosomal protein L21  39.51 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2510  hypothetical protein  40.68 
 
 		 251 aa  47.4  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.255653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1732  hypothetical protein  38.6 
 
 		 237 aa  47.4  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.248863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3059  hypothetical protein  52.63 
 
 		 626 aa  46.6  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.661615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1264  NADH dehydrogenase subunit E  63.33 
 
 		 388 aa  45.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1356  NADH dehydrogenase subunit E  63.33 
 
 		 388 aa  45.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2694  hypothetical protein  42.86 
 
 		 249 aa  45.1  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.225762  hitchhiker  0.000408142 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1314  hypothetical protein  35.09 
 
 		 239 aa  43.5  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0719888  normal  0.0263324 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1831  alpha amylase catalytic subunit  38.2 
 
 		 1253 aa  43.1  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.944012 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2280  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  48.48 
 
 		 258 aa  42.4  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.372527  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09026  hypothetical protein  67.86 
 
 		 182 aa  42  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0409768  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1266  hypothetical protein  50 
 
 		 222 aa  42  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.502472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2245  hypothetical protein  37.7 
 
 		 214 aa  42  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0103239  normal  0.10945 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1358  putative protein in NADH-ubiquinone oxidoreductase complex  50 
 
 		 226 aa  41.6  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.754294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1731  hypothetical protein  29.6 
 
 		 163 aa  41.2  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.282062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2419  NADH dehydrogenase subunit E  60 
 
 		 385 aa  41.6  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.511689  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>