More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3743 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_3743  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  100 
 
 
175 aa  353  7.999999999999999e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.101135  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5350  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  56.9 
 
 
184 aa  225  3e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6908  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  48.28 
 
 
181 aa  187  5.999999999999999e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.146925 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0421  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  49.14 
 
 
176 aa  181  5.0000000000000004e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0044  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  47.67 
 
 
179 aa  167  7e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.137994 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0965  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  47.93 
 
 
193 aa  166  1e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.738782  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0490  adenylate kinase  41.95 
 
 
374 aa  161  4.0000000000000004e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3448  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  47.27 
 
 
182 aa  153  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.472284  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01220  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  46.67 
 
 
183 aa  149  2e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12790  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.03 
 
 
184 aa  146  1.0000000000000001e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.370105  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2896  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  44.32 
 
 
184 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05570  adenylate kinase  40.7 
 
 
367 aa  147  1.0000000000000001e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0530  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  44.85 
 
 
190 aa  145  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.185084  normal  0.0224456 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0443  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  46.06 
 
 
183 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.939378  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9176  Hypoxanthine phosphoribosyltransferase  42.44 
 
 
180 aa  143  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0577662  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1623  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  44.12 
 
 
178 aa  142  3e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.381924  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4506  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  44.85 
 
 
189 aa  142  3e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0792  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  41.52 
 
 
178 aa  141  5e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0626  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  44.85 
 
 
184 aa  141  5e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2988  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.64 
 
 
183 aa  140  9.999999999999999e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1323  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  45.06 
 
 
176 aa  140  9.999999999999999e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0360186 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0847  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  42.17 
 
 
222 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32100  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  45.18 
 
 
184 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.918593  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2835  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.04 
 
 
175 aa  137  4.999999999999999e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2186  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.03 
 
 
189 aa  137  6e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.341617  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3004  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  44.59 
 
 
178 aa  137  1e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1588  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.12 
 
 
175 aa  136  1e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4745  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  45.24 
 
 
190 aa  136  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.587694  decreased coverage  0.0000288771 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8427  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  41.28 
 
 
179 aa  135  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5245  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.9 
 
 
180 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.706873 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0059  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.9 
 
 
180 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0033  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  42.07 
 
 
186 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1525  hypoxanthine phosphoribosyl transferase  41.18 
 
 
180 aa  135  4e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4309  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  45.24 
 
 
190 aa  134  4e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0523048 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0071  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.9 
 
 
180 aa  134  4e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.208347  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0062  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  43.9 
 
 
180 aa  134  5e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0063  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  43.9 
 
 
180 aa  134  5e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0059  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  43.9 
 
 
180 aa  134  5e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0059  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  43.9 
 
 
180 aa  134  5e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0059  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  43.9 
 
 
180 aa  134  5e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0063  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  43.9 
 
 
179 aa  134  5e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0075  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.9 
 
 
180 aa  134  5e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0888602  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3058  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  44.51 
 
 
172 aa  134  6.0000000000000005e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.342631  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0701  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  42.42 
 
 
179 aa  134  6.0000000000000005e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.482713 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0072  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.29 
 
 
180 aa  133  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0311  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  42.94 
 
 
183 aa  134  9.999999999999999e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1672  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  39.63 
 
 
176 aa  133  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.544224  normal  0.102762 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0134  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.83 
 
 
175 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309601  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0145  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.83 
 
 
175 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0150  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  42.33 
 
 
183 aa  132  3e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0199  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  41.88 
 
 
180 aa  132  3.9999999999999996e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0299222  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0140  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  42.42 
 
 
174 aa  131  3.9999999999999996e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000569861  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0080  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  41.32 
 
 
181 aa  131  3.9999999999999996e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.297539  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4969  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  40.61 
 
 
179 aa  130  9e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.187483 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2105  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  40.36 
 
 
183 aa  130  1.0000000000000001e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1917  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.37 
 
 
177 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0127  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  41.98 
 
 
175 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.594897  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0131  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.21 
 
 
175 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0706154  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_698  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  40.85 
 
 
182 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24790  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  41.21 
 
 
183 aa  129  2.0000000000000002e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0403  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  42.68 
 
 
179 aa  129  2.0000000000000002e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000407024  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1847  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  41.46 
 
 
187 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0169  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  45.68 
 
 
174 aa  129  3e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3479  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  41.14 
 
 
176 aa  128  3e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2752  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.12 
 
 
176 aa  128  3e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.567949  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0556  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  44.24 
 
 
188 aa  128  4.0000000000000003e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.600381  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2663  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  44.24 
 
 
180 aa  128  4.0000000000000003e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0107677 
 
 
-
 
NC_002936  DET0792  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  41.46 
 
 
181 aa  128  5.0000000000000004e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0189881  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00570  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.03 
 
 
186 aa  127  7.000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00463004  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1746  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  39.88 
 
 
172 aa  127  8.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.477142  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02170  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  39.63 
 
 
181 aa  127  8.000000000000001e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0351776  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2376  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  40.24 
 
 
179 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00118053  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0015  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  43.83 
 
 
180 aa  126  2.0000000000000002e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2787  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  41.03 
 
 
183 aa  125  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1913  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  40.51 
 
 
181 aa  125  3e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4651  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  41.14 
 
 
175 aa  125  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0267  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  40.12 
 
 
180 aa  125  3e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2473  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  40.38 
 
 
183 aa  125  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0472  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  37.89 
 
 
188 aa  124  6e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0108255  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0013  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  41.46 
 
 
180 aa  124  6e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4975  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  40.51 
 
 
175 aa  124  7e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4569  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  40.51 
 
 
175 aa  124  7e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0249  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  40.12 
 
 
167 aa  124  7e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000141498  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0299  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  45.03 
 
 
608 aa  124  7e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.347067 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0718  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  39.63 
 
 
178 aa  124  8.000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.10454  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4712  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  40.51 
 
 
183 aa  124  9e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4551  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  40.51 
 
 
175 aa  124  9e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4937  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  40.51 
 
 
175 aa  124  9e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5074  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  40.51 
 
 
183 aa  124  9e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0886  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  44.51 
 
 
182 aa  123  1e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000644191  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0297  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  40.51 
 
 
175 aa  123  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4958  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  39.87 
 
 
175 aa  124  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2148  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  41.14 
 
 
176 aa  123  1e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0187  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  41.56 
 
 
181 aa  123  1e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4942  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  40.51 
 
 
175 aa  123  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1543  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  38.79 
 
 
176 aa  123  1e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3398  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  41.77 
 
 
170 aa  122  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000262186  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1636  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  39.43 
 
 
190 aa  123  2e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0615  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.29 
 
 
195 aa  122  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0311  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.75 
 
 
182 aa  122  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.474386  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>