43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2404 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_4977  metallophosphoesterase  82.03 
 
 
396 aa  702    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.688138  hitchhiker  0.0000000713354 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2404  metallophosphoesterase  100 
 
 
406 aa  853    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1790  metallophosphoesterase  29.79 
 
 
443 aa  176  9e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.215607  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3335  metallophosphoesterase  25.23 
 
 
473 aa  75.9  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.375817 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5527  metallophosphoesterase  21.58 
 
 
632 aa  73.2  0.000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.359989 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2974  metallophosphoesterase  23.41 
 
 
643 aa  68.2  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.668826  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1160  metallophosphoesterase  25 
 
 
560 aa  61.6  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000153415  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0189  metallophosphoesterase  24.62 
 
 
515 aa  60.8  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.326449 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0042  metallophosphoesterase  23.3 
 
 
774 aa  58.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0825488 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3838  metallophosphoesterase  28.73 
 
 
442 aa  57.4  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.58711 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0615  metallophosphoesterase  26.19 
 
 
680 aa  56.2  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2499  hypothetical protein  24.52 
 
 
297 aa  55.1  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0787  putative purple acid phosphatase  25 
 
 
292 aa  54.3  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.26661 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6434  metallophosphoesterase  25.58 
 
 
266 aa  53.1  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5928  metallophosphoesterase  25.57 
 
 
239 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1170  metallophosphoesterase  25.29 
 
 
300 aa  51.6  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.936707  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5563  metallophosphoesterase  25.57 
 
 
239 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.387807  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3480  metallophosphoesterase  23.48 
 
 
532 aa  52  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8349  metallophosphoesterase  32.43 
 
 
540 aa  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31450  phosphoesterase  23.51 
 
 
426 aa  49.3  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.372288  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5806  metallophosphoesterase  20.47 
 
 
521 aa  49.3  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.737004  normal  0.176893 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02360  acid phosphatase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00800)  23.01 
 
 
497 aa  48.5  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2692  metallophosphoesterase  23.9 
 
 
468 aa  48.9  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.204655 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2778  PA14 domain protein  23.95 
 
 
978 aa  48.5  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2066  metallophosphoesterase  21.88 
 
 
686 aa  48.5  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3378  metallophosphoesterase  24.24 
 
 
449 aa  47.8  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12597  hypothetical protein  23.27 
 
 
529 aa  46.2  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1852  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  24.83 
 
 
769 aa  46.2  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00784394  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3492  metallophosphoesterase  23.78 
 
 
578 aa  45.8  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000107309  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2154  metallophosphoesterase  26.7 
 
 
1019 aa  46.2  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.0000000106564  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1967  hypothetical protein  21.86 
 
 
1194 aa  46.2  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1028  hypothetical protein  20.66 
 
 
394 aa  46.2  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.137155  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4844  putative metallophosphoesterase  23.76 
 
 
290 aa  45.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.667418  normal  0.111711 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0385  metallophosphoesterase  21.96 
 
 
701 aa  45.1  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00164005  normal  0.49014 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2049  metallophosphoesterase  22.58 
 
 
422 aa  45.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.16685 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4384  metallophosphoesterase  25.65 
 
 
586 aa  44.3  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.508778  normal  0.535785 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3316  metallophosphoesterase  25.77 
 
 
445 aa  44.3  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0944152  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6603  metallophosphoesterase  21.19 
 
 
460 aa  44.3  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.713689  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4042  metallophosphoesterase  25 
 
 
278 aa  43.9  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0208545  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0490  Ser/Thr protein phosphatase family protein  26.82 
 
 
277 aa  43.5  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3551  metallophosphoesterase  21.73 
 
 
440 aa  43.1  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0120328  normal  0.020827 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0044  Fibronectin type III domain protein  29.27 
 
 
743 aa  42.7  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3396  hypothetical protein  25.15 
 
 
447 aa  42.7  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>