22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0356 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_0356  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  100 
 
 		 428 aa  875    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0274  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  66.98 
 
 		 428 aa  578  1e-164  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0671  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  33.5 
 
 		 500 aa  87.4  4e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0415363  normal  0.502054 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1414  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  26.02 
 
 		 546 aa  62.4  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.754563  normal  0.452711 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2469  histidine kinase, HAMP region  24.24 
 
 		 269 aa  61.2  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.521658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0724  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.79 
 
 		 558 aa  60.1  0.00000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1258  sensor protein  24.04 
 
 		 356 aa  59.3  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0197  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.71 
 
 		 542 aa  55.1  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1651  histidine kinase, HAMP region  22.02 
 
 		 271 aa  55.1  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0971523  normal  0.929646 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2700  diguanylate cyclase  23.71 
 
 		 417 aa  51.2  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1131  adenylate cyclase  22.41 
 
 		 483 aa  48.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0462  hypothetical protein  27.53 
 
 		 225 aa  47.8  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00534353 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0617  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.14 
 
 		 1398 aa  47  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.536457  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1280  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  24 
 
 		 818 aa  47  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1135  adenylate cyclase  23.05 
 
 		 483 aa  45.8  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1487  stage II sporulation E family protein  25.12 
 
 		 535 aa  45.8  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2537  hypothetical protein  22.39 
 
 		 456 aa  45.8  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.220084 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1933  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.87 
 
 		 589 aa  45.1  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1565  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  40 
 
 		 200 aa  44.7  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1738  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.81 
 
 		 673 aa  44.7  0.004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0397  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  25 
 
 		 818 aa  43.9  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2835  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.43 
 
 		 964 aa  43.5  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.106901  decreased coverage  0.00127572 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>