30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2182 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2182  protein of unknown function UPF0259  100 
 
 
250 aa  483  1e-135  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0755034  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1941  protein of unknown function UPF0259  77.51 
 
 
250 aa  356  1.9999999999999998e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1998  hypothetical protein  64.66 
 
 
250 aa  293  2e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2675  hypothetical protein  59.44 
 
 
250 aa  277  1e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.236776  hitchhiker  0.0000976795 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2298  hypothetical protein  57.37 
 
 
251 aa  259  2e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1594  hypothetical protein  54.8 
 
 
247 aa  254  8e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.694906 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1412  hypothetical protein  54.8 
 
 
247 aa  254  8e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.787331  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1924  hypothetical protein  54.8 
 
 
247 aa  254  8e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00349583 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1861  hypothetical protein  54.8 
 
 
247 aa  254  8e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2393  protein of unknown function UPF0259  55.42 
 
 
247 aa  254  9e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00644905  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1364  hypothetical protein  55.02 
 
 
247 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00328229  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01229  hypothetical protein  55.02 
 
 
247 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01239  hypothetical protein  55.02 
 
 
247 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1867  hypothetical protein  54.8 
 
 
247 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.23026  normal  0.882524 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2372  hypothetical protein  55.02 
 
 
247 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.344677  hitchhiker  0.00000152892 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1877  hypothetical protein  55.02 
 
 
247 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00001512 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1413  hypothetical protein  54.62 
 
 
247 aa  253  3e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.192697  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2284  hypothetical protein  53.41 
 
 
247 aa  241  7.999999999999999e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.288365 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2050  hypothetical protein  51 
 
 
256 aa  216  4e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2324  hypothetical protein  51 
 
 
256 aa  216  4e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.830896 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1942  hypothetical protein  51 
 
 
256 aa  216  4e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.157916  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0303  hypothetical protein  45.16 
 
 
254 aa  187  1e-46  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.100156  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4303  hypothetical protein  26.29 
 
 
220 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4668  hypothetical protein  25.14 
 
 
220 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.495072  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0650  hypothetical protein  29.05 
 
 
218 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0597316  normal  0.331692 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3732  hypothetical protein  28 
 
 
221 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4771  hypothetical protein  28.81 
 
 
218 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0103496 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4646  hypothetical protein  27.91 
 
 
218 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.394398  normal  0.0700701 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4784  hypothetical protein  29.59 
 
 
218 aa  45.4  0.0009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1792  hypothetical protein  29.07 
 
 
266 aa  42.4  0.008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>