24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1998 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_1998  hypothetical protein  100 
 
 		 250 aa  483  1e-135  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2298  hypothetical protein  73.71 
 
 		 251 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2675  hypothetical protein  63.2 
 
 		 250 aa  300  2e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.236776  hitchhiker  0.0000976795 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2182  protein of unknown function UPF0259  64.4 
 
 		 250 aa  298  7e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0755034  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1941  protein of unknown function UPF0259  61.6 
 
 		 250 aa  290  2e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1594  hypothetical protein  56.63 
 
 		 247 aa  269  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.694906 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1412  hypothetical protein  56.63 
 
 		 247 aa  269  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.787331  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1861  hypothetical protein  56.63 
 
 		 247 aa  269  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1924  hypothetical protein  56.63 
 
 		 247 aa  269  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349583 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1867  hypothetical protein  56.63 
 
 		 247 aa  268  8e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.23026  normal  0.882524 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01229  hypothetical protein  56.22 
 
 		 247 aa  258  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01239  hypothetical protein  56.22 
 
 		 247 aa  258  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1364  hypothetical protein  56.22 
 
 		 247 aa  258  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00328229  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2372  hypothetical protein  56.22 
 
 		 247 aa  258  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.344677  hitchhiker  0.00000152892 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2393  protein of unknown function UPF0259  55.82 
 
 		 247 aa  258  8e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00644905  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1877  hypothetical protein  55.82 
 
 		 247 aa  258  8e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00001512 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1413  hypothetical protein  56.22 
 
 		 247 aa  257  1e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.192697  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2284  hypothetical protein  56.63 
 
 		 247 aa  255  4e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.288365 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2050  hypothetical protein  55.82 
 
 		 256 aa  235  4e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2324  hypothetical protein  55.82 
 
 		 256 aa  235  4e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.830896 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1942  hypothetical protein  55.82 
 
 		 256 aa  235  4e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.157916  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0303  hypothetical protein  42.97 
 
 		 254 aa  171  1e-41  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.100156  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3402  hypothetical protein  31.31 
 
 		 217 aa  42.7  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.572475  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4668  hypothetical protein  29.91 
 
 		 220 aa  42.4  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.495072  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>