22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2298 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2298  hypothetical protein  100 
 
 
251 aa  487  1e-137  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1998  hypothetical protein  73.71 
 
 
250 aa  319  1.9999999999999998e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2675  hypothetical protein  58.17 
 
 
250 aa  276  3e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.236776  hitchhiker  0.0000976795 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1941  protein of unknown function UPF0259  55.38 
 
 
250 aa  258  6e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2182  protein of unknown function UPF0259  57.37 
 
 
250 aa  258  8e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0755034  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2393  protein of unknown function UPF0259  54.4 
 
 
247 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00644905  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1364  hypothetical protein  54 
 
 
247 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00328229  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2372  hypothetical protein  54 
 
 
247 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.344677  hitchhiker  0.00000152892 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1877  hypothetical protein  53.6 
 
 
247 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00001512 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01239  hypothetical protein  54 
 
 
247 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01229  hypothetical protein  54 
 
 
247 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1413  hypothetical protein  53.6 
 
 
247 aa  252  5.000000000000001e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.192697  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1861  hypothetical protein  54 
 
 
247 aa  248  6e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1924  hypothetical protein  54 
 
 
247 aa  248  6e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00349583 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1412  hypothetical protein  54 
 
 
247 aa  248  6e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.787331  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1594  hypothetical protein  54 
 
 
247 aa  248  6e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.694906 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1867  hypothetical protein  54 
 
 
247 aa  247  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.23026  normal  0.882524 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2284  hypothetical protein  52.4 
 
 
247 aa  231  1e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.288365 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2324  hypothetical protein  51.39 
 
 
256 aa  210  2e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.830896 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2050  hypothetical protein  51.39 
 
 
256 aa  210  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1942  hypothetical protein  51.39 
 
 
256 aa  210  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.157916  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0303  hypothetical protein  37.25 
 
 
254 aa  145  6e-34  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.100156  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>