25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C1924 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011205  SeD_A1594  hypothetical protein  100 
 
 
247 aa  480  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.694906 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1412  hypothetical protein  100 
 
 
247 aa  480  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.787331  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1924  hypothetical protein  100 
 
 
247 aa  480  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00349583 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1861  hypothetical protein  100 
 
 
247 aa  480  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1867  hypothetical protein  99.6 
 
 
247 aa  479  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.23026  normal  0.882524 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2393  protein of unknown function UPF0259  87.04 
 
 
247 aa  410  1e-114  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00644905  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1877  hypothetical protein  87.04 
 
 
247 aa  410  1e-114  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00001512 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2372  hypothetical protein  86.64 
 
 
247 aa  410  1e-113  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.344677  hitchhiker  0.00000152892 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01239  hypothetical protein  86.64 
 
 
247 aa  410  1e-113  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01229  hypothetical protein  86.64 
 
 
247 aa  410  1e-113  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1413  hypothetical protein  86.23 
 
 
247 aa  409  1e-113  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.192697  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1364  hypothetical protein  86.64 
 
 
247 aa  410  1e-113  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00328229  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2284  hypothetical protein  84.21 
 
 
247 aa  394  1e-109  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.288365 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2675  hypothetical protein  55.82 
 
 
250 aa  259  4e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.236776  hitchhiker  0.0000976795 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1998  hypothetical protein  54.62 
 
 
250 aa  250  2e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2298  hypothetical protein  54 
 
 
251 aa  238  5.999999999999999e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2182  protein of unknown function UPF0259  54.8 
 
 
250 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0755034  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1941  protein of unknown function UPF0259  52 
 
 
250 aa  223  3e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2324  hypothetical protein  51 
 
 
256 aa  219  3.9999999999999997e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.830896 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2050  hypothetical protein  51 
 
 
256 aa  219  3.9999999999999997e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1942  hypothetical protein  51 
 
 
256 aa  219  3.9999999999999997e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.157916  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0303  hypothetical protein  37.5 
 
 
254 aa  153  2.9999999999999998e-36  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.100156  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4303  hypothetical protein  29.09 
 
 
220 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4668  hypothetical protein  26.02 
 
 
220 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.495072  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0650  hypothetical protein  27.22 
 
 
218 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0597316  normal  0.331692 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>