32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3732 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3732  hypothetical protein  100 
 
 		 221 aa  431  1e-120  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4303  hypothetical protein  43.46 
 
 		 220 aa  195  6e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4668  hypothetical protein  45.33 
 
 		 220 aa  191  6e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.495072  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0650  hypothetical protein  46.58 
 
 		 218 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0597316  normal  0.331692 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4646  hypothetical protein  48.64 
 
 		 218 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.394398  normal  0.0700701 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4771  hypothetical protein  47.73 
 
 		 218 aa  184  9e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0103496 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4784  hypothetical protein  47.73 
 
 		 218 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4927  hypothetical protein  45.54 
 
 		 253 aa  153  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1153  hypothetical protein  45.66 
 
 		 218 aa  148  8e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.345331  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12700  hypothetical protein  46.67 
 
 		 218 aa  136  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0916578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0190  hypothetical protein  27.39 
 
 		 235 aa  63.5  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4144  hypothetical protein  27.39 
 
 		 235 aa  63.5  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4277  hypothetical protein  27.39 
 
 		 235 aa  63.2  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.394205  normal  0.0726397 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0249  hypothetical protein  25.66 
 
 		 238 aa  63.5  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3593  hypothetical protein  28.66 
 
 		 241 aa  62.4  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000030216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0191  hypothetical protein  29.27 
 
 		 235 aa  62  0.000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0441  membrane protein  25.16 
 
 		 226 aa  60.5  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.899411  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3953  hypothetical protein  28.05 
 
 		 235 aa  60.1  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00215656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0320  hypothetical protein  30.49 
 
 		 235 aa  59.3  0.00000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.279071  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0248  hypothetical protein  28.14 
 
 		 237 aa  58.5  0.00000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000693847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3961  hypothetical protein  27.83 
 
 		 244 aa  58.5  0.00000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3452  hypothetical protein  25.21 
 
 		 233 aa  58.2  0.00000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3755  hypothetical protein  27.44 
 
 		 235 aa  57.8  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.728885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3828  hypothetical protein  27.44 
 
 		 235 aa  57.8  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000637636  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4560  hypothetical protein  28.05 
 
 		 263 aa  52.8  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2324  hypothetical protein  43.1 
 
 		 256 aa  45.4  0.0007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.830896 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2050  hypothetical protein  43.1 
 
 		 256 aa  45.4  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1942  hypothetical protein  43.1 
 
 		 256 aa  45.4  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.157916  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0288  hypothetical protein  25.1 
 
 		 240 aa  44.7  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3497  hypothetical protein  25.32 
 
 		 236 aa  44.7  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000878688  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09278  hypothetical protein  23.08 
 
 		 296 aa  44.7  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.237107  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2284  hypothetical protein  29.79 
 
 		 247 aa  43.1  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.288365 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>