12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0441 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0441  membrane protein  100 
 
 		 226 aa  455  1e-127  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.899411  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0650  hypothetical protein  23.77 
 
 		 218 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0597316  normal  0.331692 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3732  hypothetical protein  25.16 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4668  hypothetical protein  21.1 
 
 		 220 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.495072  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2090  hypothetical protein  30.86 
 
 		 218 aa  51.6  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.862731 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3402  hypothetical protein  29.46 
 
 		 217 aa  51.6  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.572475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1153  hypothetical protein  20.93 
 
 		 218 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.345331  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4303  hypothetical protein  20.75 
 
 		 220 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4771  hypothetical protein  22.94 
 
 		 218 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0103496 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2044  integral membrane protein-like protein  27.32 
 
 		 335 aa  43.5  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00652767  normal  0.357261 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4646  hypothetical protein  21.86 
 
 		 218 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.394398  normal  0.0700701 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4784  hypothetical protein  24.83 
 
 		 218 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>