25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3452 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_3452  hypothetical protein  100 
 
 		 233 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3953  hypothetical protein  73.91 
 
 		 235 aa  336  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00215656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3755  hypothetical protein  73.48 
 
 		 235 aa  333  1e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.728885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3828  hypothetical protein  73.48 
 
 		 235 aa  333  1e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000637636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0191  hypothetical protein  73.82 
 
 		 235 aa  333  2e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4277  hypothetical protein  73.39 
 
 		 235 aa  332  4e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.394205  normal  0.0726397 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0190  hypothetical protein  73.39 
 
 		 235 aa  331  8e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4144  hypothetical protein  73.39 
 
 		 235 aa  331  8e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0320  hypothetical protein  71.86 
 
 		 235 aa  318  5e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.279071  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0249  hypothetical protein  67.81 
 
 		 238 aa  317  1e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3593  hypothetical protein  68.7 
 
 		 241 aa  311  4.999999999999999e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000030216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0248  hypothetical protein  66.09 
 
 		 237 aa  310  2e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000693847  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4560  hypothetical protein  69.7 
 
 		 263 aa  303  1.0000000000000001e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3497  hypothetical protein  68.4 
 
 		 236 aa  293  2e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000878688  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0288  hypothetical protein  71.43 
 
 		 240 aa  293  2e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3961  hypothetical protein  61.9 
 
 		 244 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4668  hypothetical protein  26.41 
 
 		 220 aa  68.9  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.495072  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4303  hypothetical protein  27.27 
 
 		 220 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3732  hypothetical protein  26.61 
 
 		 221 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4927  hypothetical protein  26.99 
 
 		 253 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0650  hypothetical protein  22.81 
 
 		 218 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0597316  normal  0.331692 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4771  hypothetical protein  23.4 
 
 		 218 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0103496 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4784  hypothetical protein  24.37 
 
 		 218 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4646  hypothetical protein  23.4 
 
 		 218 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.394398  normal  0.0700701 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0832  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.84 
 
 		 425 aa  41.6  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>