28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_12700 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_12700  hypothetical protein  100 
 
 		 218 aa  423  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0916578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1153  hypothetical protein  95.83 
 
 		 218 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.345331  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4668  hypothetical protein  47.71 
 
 		 220 aa  197  7e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.495072  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4303  hypothetical protein  45.66 
 
 		 220 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0650  hypothetical protein  42.66 
 
 		 218 aa  178  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0597316  normal  0.331692 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3732  hypothetical protein  46.67 
 
 		 221 aa  176  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4771  hypothetical protein  44.55 
 
 		 218 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0103496 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4927  hypothetical protein  47.98 
 
 		 253 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4784  hypothetical protein  43.6 
 
 		 218 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4646  hypothetical protein  42.79 
 
 		 218 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.394398  normal  0.0700701 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3953  hypothetical protein  27.07 
 
 		 235 aa  63.2  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00215656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3755  hypothetical protein  27.07 
 
 		 235 aa  62.4  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.728885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3593  hypothetical protein  30.36 
 
 		 241 aa  61.2  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000030216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3828  hypothetical protein  26.64 
 
 		 235 aa  61.2  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000637636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0441  membrane protein  21.86 
 
 		 226 aa  60.5  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.899411  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0249  hypothetical protein  25.79 
 
 		 238 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4277  hypothetical protein  26.09 
 
 		 235 aa  59.3  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.394205  normal  0.0726397 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0191  hypothetical protein  26.09 
 
 		 235 aa  58.9  0.00000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0190  hypothetical protein  25.65 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4144  hypothetical protein  25.65 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0320  hypothetical protein  26.32 
 
 		 235 aa  55.1  0.0000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.279071  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3961  hypothetical protein  26.72 
 
 		 244 aa  53.1  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0248  hypothetical protein  23.45 
 
 		 237 aa  52.8  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000693847  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4560  hypothetical protein  24.02 
 
 		 263 aa  48.5  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3130  hypothetical protein  30.17 
 
 		 241 aa  46.6  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.258175 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3452  hypothetical protein  24.12 
 
 		 233 aa  46.2  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07940  hypothetical protein  34 
 
 		 245 aa  42.4  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.267226  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1349  hypothetical protein  25.9 
 
 		 248 aa  42  0.008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0270376 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>