More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1686 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1686  ABC transporter related  100 
 
 		 625 aa  1268    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.750234  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0431  putative ATP-binding component of a transport system  55.63 
 
 		 641 aa  649    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000359167  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0171  ABC transporter-related protein  53.38 
 
 		 639 aa  627  1e-178  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0913  ABC transporter, ATP-binding protein  56.01 
 
 		 633 aa  623  1e-177  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1011  ABC transporter related  54.03 
 
 		 636 aa  621  1e-176  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.954717  normal  0.0514719 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2477  ATPase  55.49 
 
 		 645 aa  619  1e-176  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.367976  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1388  ABC transporter related  54.18 
 
 		 623 aa  614  9.999999999999999e-175  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0285354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0499  ABC transporter related  53.53 
 
 		 631 aa  608  9.999999999999999e-173  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.107412  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1761  ABC transporter related  49.14 
 
 		 642 aa  605  1.0000000000000001e-171  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1650  ABC transporter related protein  50 
 
 		 641 aa  603  1.0000000000000001e-171  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3511  ABC transporter related  52.56 
 
 		 594 aa  604  1.0000000000000001e-171  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1988  ABC transporter ATPase component  49.06 
 
 		 637 aa  597  1e-169  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2551  ABC transporter ATPase component  49.06 
 
 		 637 aa  597  1e-169  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2640  ABC transporter ATPase component  49.06 
 
 		 637 aa  597  1e-169  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2184  ABC transporter ATP-binding protein  51.85 
 
 		 639 aa  590  1e-167  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.448903  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2095  ABC transporter related  52.17 
 
 		 623 aa  591  1e-167  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.958097  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1744  ABC transporter ATPase component  49.68 
 
 		 634 aa  587  1e-166  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.30913  hitchhiker  0.0000434555 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0384  ABC transporter related  52.55 
 
 		 628 aa  586  1e-166  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1602  ABC transporter ATPase component  47.96 
 
 		 638 aa  584  1.0000000000000001e-165  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.52947  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1681  ABC transporter ATPase component  48.91 
 
 		 649 aa  582  1.0000000000000001e-165  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2700  ABC transporter related  49.68 
 
 		 640 aa  573  1.0000000000000001e-162  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.725807  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2360  ABC transporter related  47.64 
 
 		 642 aa  571  1e-161  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.257541  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1792  ABC transporter ATPase component  50.16 
 
 		 642 aa  570  1e-161  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2052  ABC transporter related  48.43 
 
 		 640 aa  565  1e-160  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0425216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1632  ABC transporter related  50.08 
 
 		 627 aa  568  1e-160  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.27498  normal  0.259057 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2065  ABC transporter ATPase component  49.76 
 
 		 636 aa  566  1e-160  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1193  ABC transporter related  53.3 
 
 		 641 aa  567  1e-160  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.280066  decreased coverage  0.00112176 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2170  ABC transporter ATPase component  48.82 
 
 		 635 aa  566  1e-160  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000710719  normal  0.220785 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1649  ABC transporter related  48.99 
 
 		 642 aa  567  1e-160  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.39648  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0568  ABC transporter related protein  48.18 
 
 		 632 aa  563  1.0000000000000001e-159  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0138  ABC transporter related  49.14 
 
 		 643 aa  564  1.0000000000000001e-159  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3061  ABC transporter related  50.46 
 
 		 663 aa  565  1.0000000000000001e-159  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0828579 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1461  ABC transporter ATPase component  48.42 
 
 		 635 aa  562  1.0000000000000001e-159  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.185296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0618  ABC transporter related  48.57 
 
 		 635 aa  565  1.0000000000000001e-159  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000117313 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1140  ABC transporter related  48.68 
 
 		 645 aa  564  1.0000000000000001e-159  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1020  ABC transporter ATPase component  49.29 
 
 		 635 aa  559  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00168337  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1650  ABC transporter ATPase component  49.05 
 
 		 637 aa  561  1e-158  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1137  ABC transporter ATPase component  49.29 
 
 		 635 aa  560  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1171  ABC transporter ATPase component  49.29 
 
 		 635 aa  560  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.311518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1124  ABC transporter ATPase component  49.29 
 
 		 635 aa  559  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.915369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1103  ABC transporter ATPase component  49.29 
 
 		 635 aa  560  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1950  ABC transporter related  46.26 
 
 		 653 aa  559  1e-158  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1113  ABC transporter ATPase component  48.74 
 
 		 635 aa  556  1e-157  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00085111  normal  0.933236 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2398  ABC transporter related  48.45 
 
 		 650 aa  558  1e-157  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2523  ABC transporter-related protein  47.49 
 
 		 641 aa  557  1e-157  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377883  normal  0.503235 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1987  hypothetical protein  47.09 
 
 		 617 aa  554  1e-156  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1982  hypothetical protein  47.09 
 
 		 617 aa  553  1e-156  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00953  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  48.5 
 
 		 635 aa  549  1e-155  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000475773  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2694  ABC transporter related protein  48.5 
 
 		 635 aa  549  1e-155  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.562851  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2131  ABC transporter ATP-binding protein  48.99 
 
 		 642 aa  549  1e-155  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.40675  normal  0.030462 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3609  ABC transporter related  48.99 
 
 		 642 aa  549  1e-155  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.677442  normal  0.278537 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1634  ABC transporter ATPase component  45.55 
 
 		 641 aa  548  1e-155  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.202979  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2563  ABC transporter related protein  50 
 
 		 637 aa  550  1e-155  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0140209 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1673  ABC transporter related  48.67 
 
 		 642 aa  548  1e-155  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.437344 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1058  ABC transporter ATPase component  48.5 
 
 		 635 aa  549  1e-155  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000977813  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2006  ABC transporter related  44.81 
 
 		 647 aa  550  1e-155  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00960  hypothetical protein  48.5 
 
 		 635 aa  549  1e-155  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000554098  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2647  ABC transporter ATPase component  48.5 
 
 		 635 aa  549  1e-155  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0437839  hitchhiker  0.000617984 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2368  ABC transporter ATPase component  48.5 
 
 		 635 aa  547  1e-154  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.561386  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0899  ABC transporter related  48.19 
 
 		 663 aa  546  1e-154  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.998664  normal  0.488704 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14160  ABC transporter, ATP binding component  50.94 
 
 		 639 aa  546  1e-154  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1603  ABC transporter ATPase component  44.84 
 
 		 640 aa  545  1e-154  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0251377  normal  0.331537 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1064  ABC transporter ATPase component  48.5 
 
 		 635 aa  548  1e-154  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000187784  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1779  ABC transporter, ATP-binding protein  47.96 
 
 		 637 aa  546  1e-154  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000514394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003440  ABC transporter ATP-binding protein uup  45.77 
 
 		 639 aa  547  1e-154  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.550149  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1814  ABC transporter ATPase component  47.42 
 
 		 639 aa  547  1e-154  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000485056  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0975  ABC transporter ATP-binding protein  47.5 
 
 		 636 aa  543  1e-153  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000424481  normal  0.109741 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00393  ABC transporter ATP-binding protein  49.11 
 
 		 615 aa  544  1e-153  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1776  ABC transporter ATPase component  44.62 
 
 		 641 aa  541  1e-153  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.205391  hitchhiker  0.000192841 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0828  ABC transporter related  48.19 
 
 		 636 aa  542  1e-153  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2468  ABC transporter ATPase component  45.67 
 
 		 640 aa  544  1e-153  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000565711  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1572  ABC transporter related  50.79 
 
 		 603 aa  544  1e-153  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.212939 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1582  ABC transporter related  45.64 
 
 		 648 aa  542  1e-153  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0018197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2683  ABC transporter ATPase component  44.62 
 
 		 641 aa  541  1e-153  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0324813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1542  ABC transporter ATPase component  44.84 
 
 		 640 aa  543  1e-153  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2568  ABC transporter ATPase component  44.62 
 
 		 641 aa  541  1e-153  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.452475  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2608  ABC transporter ATPase component  44.62 
 
 		 641 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00157626  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1853  ABC transporter ATPase component  44.69 
 
 		 640 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3521  ABC transporter, ATP-binding protein  49.06 
 
 		 636 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3294  ABC transporter  49.22 
 
 		 636 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.313351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02012  ABC transporter, ATP-binding protein  44.22 
 
 		 646 aa  541  9.999999999999999e-153  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0535295  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2125  ABC transporter related  45.87 
 
 		 641 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.279958 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1609  ABC transporter ATPase component  44.69 
 
 		 640 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.111541 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1576  ABC transporter related  50 
 
 		 641 aa  537  1e-151  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.712623 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1419  ABC transporter:AAA ATPase  45.33 
 
 		 648 aa  536  1e-151  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.148207 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2810  ABC transporter ATPase  47.28 
 
 		 631 aa  537  1e-151  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2145  ABC transporter ATPase component  45.23 
 
 		 639 aa  536  1e-151  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.338763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3882  ABC transporter-like  49.61 
 
 		 640 aa  535  1e-150  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153189 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2382  ABC transporter related  45.13 
 
 		 649 aa  532  1e-150  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.629954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1749  ABC transporter related  45.13 
 
 		 661 aa  532  1e-150  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1093  ABC transporter ATPase component  46.25 
 
 		 639 aa  533  1e-150  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.140566  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02335  ABC transporter ATPase component  44.83 
 
 		 639 aa  535  1e-150  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2361  ABC transporter related  45.13 
 
 		 661 aa  532  1e-150  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2087  ABC transporter, ATP-binding protein  45.98 
 
 		 648 aa  530  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1144  ABC transporter, ATP-binding protein  46.21 
 
 		 660 aa  530  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261137  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2471  ABC transporter ATPase component  44.51 
 
 		 638 aa  530  1e-149  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0490995  normal  0.0499107 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2525  ABC transporter, ATP-binding protein  45.98 
 
 		 660 aa  530  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0939  ABC transporter, ATP-binding protein  46.68 
 
 		 648 aa  531  1e-149  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0496893  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1136  ABC transporter, ATP-binding protein  46.21 
 
 		 660 aa  530  1e-149  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2659  ABC transporter ATPase component  44.67 
 
 		 638 aa  530  1e-149  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>