More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2477 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU0913  ABC transporter, ATP-binding protein  56.01 
 
 
633 aa  635    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3511  ABC transporter related  54.33 
 
 
594 aa  636    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0431  putative ATP-binding component of a transport system  54.28 
 
 
641 aa  642    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000359167  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1193  ABC transporter related  60.4 
 
 
641 aa  694    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.280066  decreased coverage  0.00112176 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2477  ATPase  100 
 
 
645 aa  1311    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.367976  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0499  ABC transporter related  56.7 
 
 
631 aa  635    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.107412  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1686  ABC transporter related  55.49 
 
 
625 aa  664    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.750234  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3061  ABC transporter related  59.43 
 
 
663 aa  711    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0828579 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1761  ABC transporter related  51.46 
 
 
642 aa  625  1e-178  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0171  ABC transporter-related protein  52.93 
 
 
639 aa  620  1e-176  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1650  ABC transporter related protein  52.31 
 
 
641 aa  618  1e-175  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1388  ABC transporter related  53.76 
 
 
623 aa  613  9.999999999999999e-175  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0285354  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0138  ABC transporter related  51.38 
 
 
643 aa  609  1e-173  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0618  ABC transporter related  51.79 
 
 
635 aa  603  1.0000000000000001e-171  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000117313 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0384  ABC transporter related  53.69 
 
 
628 aa  595  1e-168  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1011  ABC transporter related  50 
 
 
636 aa  580  1e-164  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.954717  normal  0.0514719 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2360  ABC transporter related  48.3 
 
 
642 aa  575  1.0000000000000001e-163  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.257541  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2523  ABC transporter-related protein  48.77 
 
 
641 aa  575  1.0000000000000001e-163  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377883  normal  0.503235 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2551  ABC transporter ATPase component  46.74 
 
 
637 aa  566  1e-160  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2640  ABC transporter ATPase component  46.74 
 
 
637 aa  566  1e-160  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2563  ABC transporter related protein  50.15 
 
 
637 aa  567  1e-160  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0140209 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2700  ABC transporter related  48.14 
 
 
640 aa  567  1e-160  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.725807  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1950  ABC transporter related  46.69 
 
 
653 aa  566  1e-160  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1988  ABC transporter ATPase component  46.58 
 
 
637 aa  565  1e-160  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0568  ABC transporter related protein  45.76 
 
 
632 aa  567  1e-160  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1419  ABC transporter:AAA ATPase  46.29 
 
 
648 aa  561  1e-158  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.148207 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1649  ABC transporter related  49.08 
 
 
642 aa  558  1e-158  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.39648  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1987  hypothetical protein  48.11 
 
 
617 aa  556  1e-157  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1582  ABC transporter related  45.99 
 
 
648 aa  557  1e-157  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0018197  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1982  hypothetical protein  47.96 
 
 
617 aa  554  1e-156  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1632  ABC transporter related  50.47 
 
 
627 aa  551  1e-155  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.27498  normal  0.259057 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0975  ABC transporter ATP-binding protein  49.15 
 
 
636 aa  551  1e-155  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000424481  normal  0.109741 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1681  ABC transporter ATPase component  48.02 
 
 
649 aa  550  1e-155  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1144  ABC transporter, ATP-binding protein  47.49 
 
 
660 aa  547  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261137  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00393  ABC transporter ATP-binding protein  51.52 
 
 
615 aa  548  1e-154  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2184  ABC transporter ATP-binding protein  51.45 
 
 
639 aa  548  1e-154  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.448903  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2207  ABC transporter, ATP-binding protein  47.49 
 
 
648 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.829349  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2125  ABC transporter related  46.54 
 
 
641 aa  546  1e-154  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.279958 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2382  ABC transporter related  46.73 
 
 
649 aa  547  1e-154  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.629954  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2525  ABC transporter, ATP-binding protein  47.49 
 
 
660 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0828  ABC transporter related  48.53 
 
 
636 aa  545  1e-154  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0939  ABC transporter, ATP-binding protein  47.79 
 
 
648 aa  548  1e-154  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0496893  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2087  ABC transporter, ATP-binding protein  47.49 
 
 
648 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2361  ABC transporter related  46.73 
 
 
661 aa  546  1e-154  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1572  ABC transporter related  51.89 
 
 
603 aa  547  1e-154  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.212939 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1602  ABC transporter ATPase component  47.77 
 
 
638 aa  548  1e-154  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.52947  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1749  ABC transporter related  46.73 
 
 
661 aa  546  1e-154  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1744  ABC transporter ATPase component  48.14 
 
 
634 aa  546  1e-154  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.30913  hitchhiker  0.0000434555 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1136  ABC transporter, ATP-binding protein  47.49 
 
 
660 aa  547  1e-154  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0693  ABC transporter, ATP-binding protein  47.49 
 
 
648 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2397  ABC transporter related  46.42 
 
 
649 aa  542  1e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0899  ABC transporter related  49.07 
 
 
663 aa  545  1e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.998664  normal  0.488704 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3294  ABC transporter  49.22 
 
 
636 aa  543  1e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.313351  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1140  ABC transporter related  47.03 
 
 
645 aa  544  1e-153  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2170  ABC transporter ATPase component  46.8 
 
 
635 aa  543  1e-153  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000710719  normal  0.220785 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2279  ABC transporter related  46.42 
 
 
649 aa  543  1e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2095  ABC transporter related  50.23 
 
 
623 aa  543  1e-153  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.958097  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3340  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  46.11 
 
 
645 aa  542  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.790276  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3521  ABC transporter, ATP-binding protein  48.91 
 
 
636 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1298  ABC transporter, ATP-binding protein  47.49 
 
 
1065 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.524137  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5700  ABC transporter, fused ATPase subunits  46.44 
 
 
649 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2398  ABC transporter related  48.26 
 
 
650 aa  539  9.999999999999999e-153  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2006  ABC transporter related  44.55 
 
 
647 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2131  ABC transporter ATP-binding protein  48.76 
 
 
642 aa  536  1e-151  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.40675  normal  0.030462 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1171  ABC transporter ATPase component  47.58 
 
 
635 aa  537  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.311518  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1137  ABC transporter ATPase component  47.58 
 
 
635 aa  537  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1020  ABC transporter ATPase component  47.58 
 
 
635 aa  537  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00168337  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1792  ABC transporter ATPase component  46.89 
 
 
642 aa  536  1e-151  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3609  ABC transporter related  48.76 
 
 
642 aa  536  1e-151  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.677442  normal  0.278537 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1779  ABC transporter, ATP-binding protein  48.15 
 
 
637 aa  536  1e-151  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000514394  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1103  ABC transporter ATPase component  47.58 
 
 
635 aa  537  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2052  ABC transporter related  46.22 
 
 
640 aa  535  1e-151  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0425216  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1204  ABC transporter related  45.9 
 
 
648 aa  536  1e-151  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2810  ABC transporter ATPase  47.81 
 
 
631 aa  532  1e-150  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14160  ABC transporter, ATP binding component  50.69 
 
 
639 aa  535  1e-150  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1113  ABC transporter ATPase component  46.96 
 
 
635 aa  533  1e-150  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00085111  normal  0.933236 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003440  ABC transporter ATP-binding protein uup  44.92 
 
 
639 aa  533  1e-150  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.550149  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1605  ABC transporter related  48.4 
 
 
644 aa  534  1e-150  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0890354  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1673  ABC transporter related  48.39 
 
 
642 aa  533  1e-150  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.437344 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1124  ABC transporter ATPase component  47.43 
 
 
635 aa  533  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.915369  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00953  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  46.8 
 
 
635 aa  530  1e-149  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000475773  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2694  ABC transporter related protein  46.8 
 
 
635 aa  530  1e-149  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.562851  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0609  ABC transporter, ATP-binding protein  50.16 
 
 
632 aa  530  1e-149  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.446122  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0918  ABC transporter related  47.05 
 
 
688 aa  531  1e-149  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.101083 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2647  ABC transporter ATPase component  46.8 
 
 
635 aa  530  1e-149  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0437839  hitchhiker  0.000617984 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02012  ABC transporter, ATP-binding protein  44.58 
 
 
646 aa  530  1e-149  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0535295  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1058  ABC transporter ATPase component  46.8 
 
 
635 aa  530  1e-149  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000977813  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00960  hypothetical protein  46.8 
 
 
635 aa  530  1e-149  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000554098  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1199  ABC transporter related  47.08 
 
 
648 aa  530  1e-149  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.219582  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1576  ABC transporter related  50.46 
 
 
641 aa  531  1e-149  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.712623 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02335  ABC transporter ATPase component  45.08 
 
 
639 aa  531  1e-149  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1650  ABC transporter ATPase component  46.83 
 
 
637 aa  531  1e-149  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1064  ABC transporter ATPase component  46.8 
 
 
635 aa  528  1e-148  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000187784  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1603  ABC transporter ATPase component  44.99 
 
 
640 aa  525  1e-148  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0251377  normal  0.331537 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2145  ABC transporter ATPase component  46.14 
 
 
639 aa  526  1e-148  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.338763  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2368  ABC transporter ATPase component  46.8 
 
 
635 aa  528  1e-148  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.561386  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1776  ABC transporter ATPase component  45.01 
 
 
641 aa  523  1e-147  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.205391  hitchhiker  0.000192841 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2608  ABC transporter ATPase component  44.88 
 
 
641 aa  523  1e-147  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00157626  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1542  ABC transporter ATPase component  44.99 
 
 
640 aa  524  1e-147  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2683  ABC transporter ATPase component  45.01 
 
 
641 aa  523  1e-147  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0324813  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>