24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_3887 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_3887  Chloride channel core  100 
 
 		 453 aa  867    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.407099 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3837  Chloride channel core  100 
 
 		 453 aa  867    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2309  Chloride channel core  80.57 
 
 		 453 aa  552  1e-156  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5304  Chloride channel core  81.24 
 
 		 453 aa  552  1e-156  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1486  Cl- channel, voltage gated  26.25 
 
 		 448 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0757  Chloride channel core  25.85 
 
 		 528 aa  55.8  0.000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.937422  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4619  voltage-gated chloride channel family protein  26.25 
 
 		 452 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3102  chloride channel protein  25.99 
 
 		 471 aa  51.2  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.965417  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1884  voltage gated chloride channel family protein  24 
 
 		 519 aa  50.4  0.00006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1576  chloride channel protein  27.33 
 
 		 463 aa  49.3  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.803836 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0224  chloride channel protein  27.12 
 
 		 473 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.154288  normal  0.638237 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0226  chloride channel protein  27.12 
 
 		 473 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0240  chloride channel protein  27.12 
 
 		 473 aa  48.5  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0223  chloride channel protein  27.12 
 
 		 473 aa  48.5  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.230311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0241  chloride channel protein  27.12 
 
 		 473 aa  48.5  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0165964  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2173  voltage-gated chloride channel family protein  24 
 
 		 519 aa  47.8  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6970  Cl- channel voltage-gated family protein  24.15 
 
 		 452 aa  47.4  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.06762  normal  0.0370361 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14511  chloride channel  26.8 
 
 		 455 aa  46.6  0.0009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0782  chloride channel protein  26.72 
 
 		 479 aa  46.2  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.12239 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0695  chloride channel protein  28.09 
 
 		 466 aa  45.4  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.750689  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2366  Cl- channel voltage-gated family protein  19.69 
 
 		 416 aa  43.9  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1026  chloride channel core  24.51 
 
 		 421 aa  43.5  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.724519  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4064  Cl- channel, voltage gated  27.57 
 
 		 602 aa  43.5  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3703  Chloride channel core  25.57 
 
 		 436 aa  43.1  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.474043  hitchhiker  0.000487156 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>