19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_5304 on replicon NC_011880
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2309  Chloride channel core  97.79 
 
 
453 aa  689    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5304  Chloride channel core  100 
 
 
453 aa  867    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3887  Chloride channel core  81.24 
 
 
453 aa  600  1e-170  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.407099 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3837  Chloride channel core  81.24 
 
 
453 aa  600  1e-170  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0757  Chloride channel core  25.88 
 
 
528 aa  64.7  0.000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.937422  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3102  chloride channel protein  24.85 
 
 
471 aa  50.4  0.00007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.965417  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6970  Cl- channel voltage-gated family protein  26.1 
 
 
452 aa  50.1  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.06762  normal  0.0370361 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4619  voltage-gated chloride channel family protein  25.5 
 
 
452 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1486  Cl- channel, voltage gated  25.5 
 
 
448 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1576  chloride channel protein  28.78 
 
 
463 aa  48.1  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.803836 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0191  chloride channel core  26.81 
 
 
635 aa  45.4  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.66054  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1059  Chloride channel core  25.77 
 
 
625 aa  44.3  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2179  voltage-gated chloride channel  25 
 
 
528 aa  44.3  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1327  chloride channel core  24.92 
 
 
579 aa  43.9  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.775399  normal  0.325244 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2810  chloride channel protein  29.85 
 
 
472 aa  43.5  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14511  chloride channel  23.87 
 
 
455 aa  43.5  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4920  Cl- channel, voltage-gated family protein  20.76 
 
 
426 aa  43.5  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0224  chloride channel protein  24.29 
 
 
473 aa  43.1  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.154288  normal  0.638237 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0226  chloride channel protein  24.29 
 
 
473 aa  43.1  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>