43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_5102 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_5102  protein of unknown function DUF1400  100 
 
 
181 aa  353  8.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.24506 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3090  hypothetical protein  40.56 
 
 
545 aa  108  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000551056  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2716  hypothetical protein  40.91 
 
 
546 aa  100  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3930  protein of unknown function DUF1400  35.8 
 
 
607 aa  90.5  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.200649 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2609  hypothetical protein  32.97 
 
 
176 aa  84.7  7e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0807675 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4841  protein of unknown function DUF1400  38.97 
 
 
225 aa  79.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.444038  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2694  hypothetical protein  31.85 
 
 
168 aa  71.6  0.000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2320  hypothetical protein  30 
 
 
193 aa  70.1  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1240  protein of unknown function DUF1400  30.71 
 
 
181 aa  68.6  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.35348 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1211  protein of unknown function DUF1400  30.71 
 
 
181 aa  68.6  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2964  hypothetical protein  24.03 
 
 
543 aa  68.2  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1864  hypothetical protein  31.01 
 
 
176 aa  67.8  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4547  protein of unknown function DUF1400  32.28 
 
 
533 aa  67.4  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3157  protein of unknown function DUF1400  29.92 
 
 
179 aa  67.4  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.651627 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3976  hypothetical protein  28.08 
 
 
601 aa  63.2  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.671278  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3825  protein of unknown function DUF1400  28 
 
 
547 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4229  protein of unknown function DUF1400  26.76 
 
 
568 aa  62  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1807  hypothetical protein  29.1 
 
 
190 aa  60.8  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.840232  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2531  protein of unknown function DUF1400  30.26 
 
 
572 aa  60.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.732033  normal  0.144228 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3583  protein of unknown function DUF1400  30.26 
 
 
572 aa  60.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3241  protein of unknown function DUF1400  25.2 
 
 
567 aa  60.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1455  protein of unknown function DUF1400  31.25 
 
 
328 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2256  hypothetical protein  31.58 
 
 
184 aa  58.9  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.043816  normal  0.0878131 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0936  protein of unknown function DUF1400  24.48 
 
 
178 aa  57.8  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19241  hypothetical protein  25.17 
 
 
190 aa  57.4  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.446441  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_19051  hypothetical protein  27.01 
 
 
190 aa  56.6  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21991  hypothetical protein  25.17 
 
 
184 aa  56.6  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4384  protein of unknown function DUF1400  28.97 
 
 
605 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.101972 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4546  protein of unknown function DUF1400  26.39 
 
 
551 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2723  protein of unknown function DUF1400  27.68 
 
 
571 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128578  hitchhiker  0.00368016 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1326  hypothetical protein  25.17 
 
 
184 aa  55.5  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.300208  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0494  protein of unknown function DUF1400  26.67 
 
 
569 aa  55.1  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0319024  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1136  protein of unknown function DUF1400  25.58 
 
 
600 aa  54.3  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1800  protein of unknown function DUF1400  23.91 
 
 
542 aa  53.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1166  protein of unknown function DUF1400  25.58 
 
 
600 aa  52  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30221  hypothetical protein  28.66 
 
 
195 aa  51.2  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.356842 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2117  hypothetical protein  22.78 
 
 
567 aa  50.1  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.383292  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2897  hypothetical protein  26.67 
 
 
179 aa  49.7  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153018  normal  0.0250566 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2145  protein of unknown function DUF1400  25.68 
 
 
570 aa  48.5  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.367657 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0025  hypothetical protein  24.26 
 
 
568 aa  46.2  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.797513 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0391  hypothetical protein  30.08 
 
 
526 aa  45.4  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0764093  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18531  hypothetical protein  25.47 
 
 
188 aa  44.7  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.340304  normal  0.0277633 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0834  hypothetical protein  25.2 
 
 
217 aa  42.7  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.279042  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>