29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2609 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2609  hypothetical protein  100 
 
 
176 aa  347  5e-95  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0807675 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2256  hypothetical protein  52.94 
 
 
184 aa  133  1.9999999999999998e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.043816  normal  0.0878131 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0834  hypothetical protein  39.86 
 
 
217 aa  114  6.9999999999999995e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.279042  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2320  hypothetical protein  34.3 
 
 
193 aa  95.9  3e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2694  hypothetical protein  33.77 
 
 
168 aa  87  1e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5102  protein of unknown function DUF1400  33.77 
 
 
181 aa  84.3  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.24506 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30221  hypothetical protein  31.4 
 
 
195 aa  82.8  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.356842 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1211  protein of unknown function DUF1400  34.67 
 
 
181 aa  73.2  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_19061  hypothetical protein  30.52 
 
 
190 aa  73.2  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.96466  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1240  protein of unknown function DUF1400  34.67 
 
 
181 aa  73.2  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.35348 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1864  hypothetical protein  34.46 
 
 
176 aa  73.2  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1807  hypothetical protein  31.21 
 
 
190 aa  71.6  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.840232  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2897  hypothetical protein  28.66 
 
 
179 aa  69.7  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153018  normal  0.0250566 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3157  protein of unknown function DUF1400  35 
 
 
179 aa  67  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.651627 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19241  hypothetical protein  29.3 
 
 
190 aa  66.6  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.446441  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_19051  hypothetical protein  28.66 
 
 
190 aa  63.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2964  hypothetical protein  33.33 
 
 
543 aa  60.5  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18531  hypothetical protein  28.12 
 
 
188 aa  58.9  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.340304  normal  0.0277633 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3090  hypothetical protein  31.91 
 
 
545 aa  57.8  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000551056  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3930  protein of unknown function DUF1400  29.34 
 
 
607 aa  55.5  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.200649 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2716  hypothetical protein  32.89 
 
 
546 aa  54.7  0.0000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3583  protein of unknown function DUF1400  30.2 
 
 
572 aa  53.9  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3825  protein of unknown function DUF1400  28.98 
 
 
547 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2531  protein of unknown function DUF1400  30.2 
 
 
572 aa  53.9  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.732033  normal  0.144228 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2117  hypothetical protein  20.79 
 
 
567 aa  48.1  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.383292  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4229  protein of unknown function DUF1400  25.71 
 
 
568 aa  45.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3241  protein of unknown function DUF1400  22.78 
 
 
567 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1455  protein of unknown function DUF1400  27.64 
 
 
328 aa  42.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0692  hypothetical protein  29.19 
 
 
184 aa  40.8  0.01  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.1442  normal  0.56084 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>