32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_19241 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008816  A9601_19241  hypothetical protein  100 
 
 
190 aa  374  1e-103  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.446441  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_19051  hypothetical protein  90 
 
 
190 aa  337  5e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1807  hypothetical protein  86.55 
 
 
190 aa  300  9e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.840232  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_19061  hypothetical protein  70 
 
 
190 aa  269  2e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.96466  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21991  hypothetical protein  40.11 
 
 
184 aa  132  3e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30221  hypothetical protein  38.46 
 
 
195 aa  129  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.356842 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1326  hypothetical protein  38.98 
 
 
184 aa  128  5.0000000000000004e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.300208  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18531  hypothetical protein  35.29 
 
 
188 aa  127  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.340304  normal  0.0277633 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2694  hypothetical protein  33.12 
 
 
168 aa  104  7e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2320  hypothetical protein  28.19 
 
 
193 aa  93.2  2e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1864  hypothetical protein  27.93 
 
 
176 aa  71.2  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2256  hypothetical protein  25.81 
 
 
184 aa  70.5  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.043816  normal  0.0878131 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3157  protein of unknown function DUF1400  29.53 
 
 
179 aa  69.7  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.651627 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1240  protein of unknown function DUF1400  26.9 
 
 
181 aa  67.8  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.35348 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1211  protein of unknown function DUF1400  26.9 
 
 
181 aa  67.8  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2609  hypothetical protein  29.3 
 
 
176 aa  66.6  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0807675 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3930  protein of unknown function DUF1400  25 
 
 
607 aa  61.6  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.200649 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2964  hypothetical protein  32.28 
 
 
543 aa  60.5  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3825  protein of unknown function DUF1400  31.17 
 
 
547 aa  57.8  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5102  protein of unknown function DUF1400  25.87 
 
 
181 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.24506 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4229  protein of unknown function DUF1400  29.6 
 
 
568 aa  52.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3241  protein of unknown function DUF1400  27.45 
 
 
567 aa  52.4  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3976  hypothetical protein  29.45 
 
 
601 aa  49.3  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.671278  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4547  protein of unknown function DUF1400  28.57 
 
 
533 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2117  hypothetical protein  19.87 
 
 
567 aa  46.6  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.383292  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0502  hypothetical protein  24.02 
 
 
215 aa  46.2  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.263156  normal  0.249207 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0494  protein of unknown function DUF1400  25.17 
 
 
569 aa  45.1  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0319024  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2897  hypothetical protein  23.19 
 
 
179 aa  44.3  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153018  normal  0.0250566 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0351  protein of unknown function DUF1400  23.12 
 
 
166 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0358  protein of unknown function DUF1400  23.12 
 
 
166 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0680518  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1800  protein of unknown function DUF1400  21.47 
 
 
542 aa  42.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1136  protein of unknown function DUF1400  25.13 
 
 
600 aa  41.6  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>