42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3157 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3157  protein of unknown function DUF1400  100 
 
 
179 aa  358  2e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.651627 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1240  protein of unknown function DUF1400  60.4 
 
 
181 aa  202  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.35348 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1211  protein of unknown function DUF1400  60.4 
 
 
181 aa  202  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1864  hypothetical protein  49.38 
 
 
176 aa  148  4e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3930  protein of unknown function DUF1400  33.15 
 
 
607 aa  94.4  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.200649 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2897  hypothetical protein  31.62 
 
 
179 aa  85.5  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153018  normal  0.0250566 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3976  hypothetical protein  35.95 
 
 
601 aa  78.2  0.00000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.671278  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3825  protein of unknown function DUF1400  30.99 
 
 
547 aa  77.4  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4229  protein of unknown function DUF1400  27.22 
 
 
568 aa  72  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19241  hypothetical protein  29.53 
 
 
190 aa  69.7  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.446441  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_19051  hypothetical protein  29.14 
 
 
190 aa  69.7  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1807  hypothetical protein  27.03 
 
 
190 aa  68.9  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.840232  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5102  protein of unknown function DUF1400  29.92 
 
 
181 aa  67.8  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.24506 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2609  hypothetical protein  35 
 
 
176 aa  67  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0807675 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21991  hypothetical protein  29.49 
 
 
184 aa  67.4  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1326  hypothetical protein  26.42 
 
 
184 aa  67  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.300208  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2964  hypothetical protein  35.25 
 
 
543 aa  66.2  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_19061  hypothetical protein  24.71 
 
 
190 aa  65.5  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.96466  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4547  protein of unknown function DUF1400  28.45 
 
 
533 aa  62.8  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2716  hypothetical protein  29.25 
 
 
546 aa  62.4  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0351  protein of unknown function DUF1400  28.19 
 
 
166 aa  60.8  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0358  protein of unknown function DUF1400  28.19 
 
 
166 aa  60.8  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0680518  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2117  hypothetical protein  27.98 
 
 
567 aa  60.5  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.383292  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2723  protein of unknown function DUF1400  28.93 
 
 
571 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128578  hitchhiker  0.00368016 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3241  protein of unknown function DUF1400  26.57 
 
 
567 aa  59.3  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2694  hypothetical protein  26.21 
 
 
168 aa  58.5  0.00000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4384  protein of unknown function DUF1400  29.41 
 
 
605 aa  58.2  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.101972 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1455  protein of unknown function DUF1400  32.81 
 
 
328 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2256  hypothetical protein  30.07 
 
 
184 aa  55.8  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.043816  normal  0.0878131 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0936  protein of unknown function DUF1400  27.27 
 
 
178 aa  55.5  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2531  protein of unknown function DUF1400  26.58 
 
 
572 aa  54.3  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.732033  normal  0.144228 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3583  protein of unknown function DUF1400  26.58 
 
 
572 aa  54.3  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4546  protein of unknown function DUF1400  23.18 
 
 
551 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2145  protein of unknown function DUF1400  28.15 
 
 
570 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.367657 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0494  protein of unknown function DUF1400  28.3 
 
 
569 aa  52.4  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0319024  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3090  hypothetical protein  28.78 
 
 
545 aa  52  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000551056  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30221  hypothetical protein  22.67 
 
 
195 aa  52  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.356842 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0834  hypothetical protein  26.36 
 
 
217 aa  49.3  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.279042  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2320  hypothetical protein  21.74 
 
 
193 aa  45.1  0.0005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4841  protein of unknown function DUF1400  27.59 
 
 
225 aa  42  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.444038  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1800  protein of unknown function DUF1400  22.45 
 
 
542 aa  41.6  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18531  hypothetical protein  26.35 
 
 
188 aa  41.6  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.340304  normal  0.0277633 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>