28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2256 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2256  hypothetical protein  100 
 
 
184 aa  355  1.9999999999999998e-97  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.043816  normal  0.0878131 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2609  hypothetical protein  51.43 
 
 
176 aa  134  6.0000000000000005e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0807675 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0834  hypothetical protein  48.46 
 
 
217 aa  114  6.9999999999999995e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.279042  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1864  hypothetical protein  34.03 
 
 
176 aa  82.8  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1240  protein of unknown function DUF1400  35.1 
 
 
181 aa  77.4  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.35348 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1211  protein of unknown function DUF1400  35.1 
 
 
181 aa  77.4  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30221  hypothetical protein  35.65 
 
 
195 aa  73.6  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.356842 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19241  hypothetical protein  25 
 
 
190 aa  72.8  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.446441  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2897  hypothetical protein  28.28 
 
 
179 aa  68.9  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153018  normal  0.0250566 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2694  hypothetical protein  30.08 
 
 
168 aa  63.9  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1807  hypothetical protein  26.17 
 
 
190 aa  63.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.840232  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3825  protein of unknown function DUF1400  32.92 
 
 
547 aa  62.4  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_19061  hypothetical protein  29.69 
 
 
190 aa  62.4  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.96466  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2320  hypothetical protein  31.37 
 
 
193 aa  60.1  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5102  protein of unknown function DUF1400  30.67 
 
 
181 aa  57  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.24506 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2964  hypothetical protein  29.14 
 
 
543 aa  55.8  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3157  protein of unknown function DUF1400  30.07 
 
 
179 aa  55.5  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.651627 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1455  protein of unknown function DUF1400  31.39 
 
 
328 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18531  hypothetical protein  27.34 
 
 
188 aa  51.6  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.340304  normal  0.0277633 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4546  protein of unknown function DUF1400  27.48 
 
 
551 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2716  hypothetical protein  27.52 
 
 
546 aa  48.9  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0502  hypothetical protein  25.62 
 
 
215 aa  48.5  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.263156  normal  0.249207 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3583  protein of unknown function DUF1400  29.63 
 
 
572 aa  46.2  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2531  protein of unknown function DUF1400  29.63 
 
 
572 aa  46.2  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.732033  normal  0.144228 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3090  hypothetical protein  27.4 
 
 
545 aa  45.4  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000551056  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3930  protein of unknown function DUF1400  29.63 
 
 
607 aa  44.7  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.200649 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1136  protein of unknown function DUF1400  28.37 
 
 
600 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1166  protein of unknown function DUF1400  29.86 
 
 
600 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>