19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0834 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0834  hypothetical protein  100 
 
 
217 aa  437  9.999999999999999e-123  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.279042  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2609  hypothetical protein  39.86 
 
 
176 aa  114  7.999999999999999e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0807675 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2256  hypothetical protein  48.82 
 
 
184 aa  112  6e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.043816  normal  0.0878131 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1864  hypothetical protein  31.11 
 
 
176 aa  64.7  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1240  protein of unknown function DUF1400  29.84 
 
 
181 aa  58.2  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.35348 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1211  protein of unknown function DUF1400  29.84 
 
 
181 aa  58.2  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2694  hypothetical protein  24.29 
 
 
168 aa  56.6  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3930  protein of unknown function DUF1400  31.35 
 
 
607 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.200649 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30221  hypothetical protein  26.11 
 
 
195 aa  56.2  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.356842 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2897  hypothetical protein  27.45 
 
 
179 aa  53.9  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153018  normal  0.0250566 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2320  hypothetical protein  24.54 
 
 
193 aa  52.8  0.000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_19061  hypothetical protein  27.85 
 
 
190 aa  52  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.96466  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3157  protein of unknown function DUF1400  26.43 
 
 
179 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.651627 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1326  hypothetical protein  22.3 
 
 
184 aa  48.5  0.00008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.300208  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3825  protein of unknown function DUF1400  27.45 
 
 
547 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0936  protein of unknown function DUF1400  26.81 
 
 
178 aa  46.2  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2964  hypothetical protein  24.42 
 
 
543 aa  46.2  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5102  protein of unknown function DUF1400  25.2 
 
 
181 aa  42.4  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.24506 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2716  hypothetical protein  31.58 
 
 
546 aa  42  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>