31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0936 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0936  protein of unknown function DUF1400  100 
 
 
178 aa  362  1e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0358  protein of unknown function DUF1400  64.33 
 
 
166 aa  219  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0680518  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0351  protein of unknown function DUF1400  64.33 
 
 
166 aa  219  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2964  hypothetical protein  38.26 
 
 
543 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3241  protein of unknown function DUF1400  38.41 
 
 
567 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4229  protein of unknown function DUF1400  38.16 
 
 
568 aa  97.8  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4546  protein of unknown function DUF1400  37.34 
 
 
551 aa  96.3  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3825  protein of unknown function DUF1400  38.16 
 
 
547 aa  92.8  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3930  protein of unknown function DUF1400  35.06 
 
 
607 aa  90.9  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.200649 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2531  protein of unknown function DUF1400  33.57 
 
 
572 aa  82  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.732033  normal  0.144228 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3583  protein of unknown function DUF1400  33.57 
 
 
572 aa  82  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4547  protein of unknown function DUF1400  34.33 
 
 
533 aa  70.9  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2723  protein of unknown function DUF1400  29.86 
 
 
571 aa  68.6  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128578  hitchhiker  0.00368016 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2032  hypothetical protein  30.11 
 
 
565 aa  66.2  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.347615  normal  0.0686681 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3976  hypothetical protein  31.08 
 
 
601 aa  65.5  0.0000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.671278  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2117  hypothetical protein  28.03 
 
 
567 aa  63.5  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.383292  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2897  hypothetical protein  29.27 
 
 
179 aa  62.4  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153018  normal  0.0250566 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1800  protein of unknown function DUF1400  25.66 
 
 
542 aa  57.8  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2145  protein of unknown function DUF1400  26.71 
 
 
570 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.367657 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0025  hypothetical protein  26.54 
 
 
568 aa  55.5  0.0000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.797513 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3157  protein of unknown function DUF1400  27.07 
 
 
179 aa  55.1  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.651627 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5102  protein of unknown function DUF1400  24.29 
 
 
181 aa  54.7  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.24506 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1136  protein of unknown function DUF1400  28.75 
 
 
600 aa  54.3  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1240  protein of unknown function DUF1400  26.52 
 
 
181 aa  54.3  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.35348 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1211  protein of unknown function DUF1400  26.52 
 
 
181 aa  54.3  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1864  hypothetical protein  25.76 
 
 
176 aa  51.2  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1166  protein of unknown function DUF1400  28.12 
 
 
600 aa  51.2  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0494  protein of unknown function DUF1400  26.85 
 
 
569 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0319024  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2716  hypothetical protein  25.48 
 
 
546 aa  47.4  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0834  hypothetical protein  26.81 
 
 
217 aa  46.6  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.279042  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19241  hypothetical protein  25.57 
 
 
190 aa  41.6  0.006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.446441  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>