60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0711 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_0711  arsenate reductase and related  100 
 
 
118 aa  243  4e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0740  arsenate reductase and related  47.71 
 
 
115 aa  117  4.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02535  hypothetical protein  52.94 
 
 
99 aa  102  2e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.414012  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2040  arsenate reductase-like protein  34.41 
 
 
114 aa  55.5  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.614417  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1109  arsenate reductase and related  29.91 
 
 
122 aa  55.1  0.0000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2487  arsenate reductase and related  31.68 
 
 
118 aa  53.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.247557  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2255  arsenate reductase and related  23.48 
 
 
138 aa  50.1  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.147 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3508  arsenate reductase and related  30.69 
 
 
116 aa  47.8  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2269  arsenate reductase and related  28.28 
 
 
118 aa  47.4  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.81941e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1992  arsenate reductase and related  26.73 
 
 
126 aa  47.4  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.788879  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2191  hypothetical protein  28.85 
 
 
121 aa  47.4  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0911  arsenate reductase  27.93 
 
 
142 aa  47  0.00009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0335675  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0736  arsenate reductase and related  30.77 
 
 
118 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.127695 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2092  transcriptional regulator Spx  28.85 
 
 
132 aa  47  0.00009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00819419  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1151  arsenate reductase and related  26.42 
 
 
112 aa  46.2  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1858  hypothetical protein  22.77 
 
 
134 aa  45.4  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000117045 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0080  arsenate reductase and related  27.45 
 
 
118 aa  45.8  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2120  hypothetical protein  22.77 
 
 
134 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136952 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1863  arsenate reductase and related  28.57 
 
 
114 aa  45.4  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000185327 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0849  arsenate reductase  26.47 
 
 
108 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1087  arsenate reductase and related  26.55 
 
 
114 aa  45.1  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.95059 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2514  arsenate reductase and related  30.69 
 
 
115 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.226515  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2470  hypothetical protein  22.77 
 
 
114 aa  44.7  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2469  arsenate reductase and related  22.64 
 
 
152 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0609366  normal  0.0790586 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1913  arsenate reductase and related  22.77 
 
 
134 aa  44.3  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000600742 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2353  arsenate reductase and related  22.64 
 
 
152 aa  44.3  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.356753  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1058  arsenate reductase and related  32.41 
 
 
116 aa  44.3  0.0006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.115844  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0920  arsenate reductase-like protein  25.66 
 
 
114 aa  44.3  0.0006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2041  arsenate reductase and related  25.49 
 
 
108 aa  43.9  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0387  hypothetical protein  25.49 
 
 
108 aa  43.9  0.0007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.296672  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0545  arsenate reductase  23.68 
 
 
128 aa  43.9  0.0007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2328  hypothetical protein  30.69 
 
 
115 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0361475  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1068  arsenate reductase  29.57 
 
 
118 aa  43.1  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0848  hypothetical protein  29.63 
 
 
118 aa  43.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000170157  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0831  hypothetical protein  29.63 
 
 
118 aa  43.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0222832  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1357  hypothetical protein  23.81 
 
 
118 aa  43.5  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2122  arsenate reductase and related  22.77 
 
 
135 aa  43.5  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.782888  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2957  hypothetical protein  28.71 
 
 
138 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.93361  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0763  transcriptional regulator Spx  23.64 
 
 
132 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2033  hypothetical protein  29.7 
 
 
121 aa  42.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15090  hypothetical protein  28.57 
 
 
119 aa  42.4  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.737886  normal  0.836167 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1618  transcriptional regulator Spx  23.64 
 
 
132 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0094  hypothetical protein  26.47 
 
 
118 aa  42.4  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2189  arsenate reductase and related  25.74 
 
 
114 aa  42.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00825632 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1227  arsenate reductase-like protein  24.32 
 
 
116 aa  42.7  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0377226  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10960  hypothetical protein  26.8 
 
 
120 aa  41.6  0.003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.262634  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1845  hypothetical protein  25.74 
 
 
115 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.404763  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0770  arsenate reductase and related  29.67 
 
 
103 aa  42  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.224236 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2366  arsenate reductase and related  21.7 
 
 
152 aa  41.2  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0297547  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1993  arsenate reductase and related  21.7 
 
 
114 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0107394  hitchhiker  0.0000000433192 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1642  arsenate reductase and related  25.53 
 
 
119 aa  41.2  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01143  ArsC family protein  24.74 
 
 
118 aa  41.2  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.013195  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0484  hypothetical protein  26.42 
 
 
117 aa  41.2  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3411  transcriptional regulator Spx  20.72 
 
 
131 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000835539  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0078  transcriptional regulator Spx  25.96 
 
 
132 aa  40.8  0.006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4201  arsenate reductase  23.36 
 
 
138 aa  40.8  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1030  arsenate reductase-like protein  24.56 
 
 
117 aa  40.8  0.007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3423  transcriptional regulator Spx  20.72 
 
 
131 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.126084  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1726  arsenate reductase and related  29.2 
 
 
105 aa  40.4  0.007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3168  hypothetical protein  28.71 
 
 
115 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.533706  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>