16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1360 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_1360  hypothetical protein  100 
 
 
235 aa  482  1e-135  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2131  nitroreductase  76.07 
 
 
235 aa  384  1e-106  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0059  Nitroreductase  30.4 
 
 
261 aa  118  7.999999999999999e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23020  nitroreductase family protein  32.11 
 
 
249 aa  115  6e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.373892  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06530  nitroreductase family protein  28.38 
 
 
231 aa  108  5e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000696704  normal  0.412825 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1195  nitroreductase  29.8 
 
 
256 aa  106  3e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.300642 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24230  nitroreductase family protein  33.2 
 
 
250 aa  103  2e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf121  nitroreductase family protein  31.67 
 
 
224 aa  91.3  1e-17  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1558  nitroreductase  29.58 
 
 
287 aa  75.5  0.0000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000161675 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2590  nitroreductase  29.83 
 
 
287 aa  70.5  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000091924  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3093  hypothetical protein  25.3 
 
 
281 aa  54.7  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1598  nitroreductase  24.22 
 
 
224 aa  46.6  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1049  hypothetical protein  25.21 
 
 
265 aa  47  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1206  hypothetical protein  28.17 
 
 
206 aa  44.7  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000154842  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1249  hypothetical protein  28.64 
 
 
206 aa  43.5  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3255  nitroreductase  23.96 
 
 
259 aa  42.7  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>