22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_3093 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_3093  hypothetical protein  100 
 
 
281 aa  580  1.0000000000000001e-165  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2590  nitroreductase  46.18 
 
 
287 aa  241  1e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000091924  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1558  nitroreductase  39.29 
 
 
287 aa  214  1.9999999999999998e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000161675 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23020  nitroreductase family protein  26.36 
 
 
249 aa  68.2  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.373892  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24230  nitroreductase family protein  28.03 
 
 
250 aa  63.2  0.000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1249  hypothetical protein  24.28 
 
 
206 aa  55.5  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1360  hypothetical protein  25.3 
 
 
235 aa  54.7  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1206  hypothetical protein  24.69 
 
 
206 aa  53.1  0.000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000154842  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  26.29 
 
 
188 aa  53.1  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0694  hypothetical protein  22.09 
 
 
254 aa  49.7  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2131  nitroreductase  24.69 
 
 
235 aa  48.9  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  33.33 
 
 
178 aa  46.2  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2684  nitroreductase  26.67 
 
 
178 aa  45.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3255  nitroreductase  19.67 
 
 
259 aa  45.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3002  nitroreductase  28.33 
 
 
195 aa  44.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.454313  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  28.25 
 
 
190 aa  43.9  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  28.19 
 
 
178 aa  44.3  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1598  nitroreductase  33.87 
 
 
224 aa  43.5  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  22.4 
 
 
186 aa  43.1  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1195  nitroreductase  24.05 
 
 
256 aa  43.1  0.005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.300642 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0116  nitroreductase  40.98 
 
 
171 aa  42.7  0.006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  23.71 
 
 
186 aa  42.4  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>