14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_06530 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_06530  nitroreductase family protein  100 
 
 
231 aa  485  1e-136  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000696704  normal  0.412825 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf121  nitroreductase family protein  33.78 
 
 
224 aa  135  8e-31  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0059  Nitroreductase  34.17 
 
 
261 aa  118  7.999999999999999e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23020  nitroreductase family protein  30.34 
 
 
249 aa  109  3e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.373892  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1360  hypothetical protein  28.38 
 
 
235 aa  108  5e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24230  nitroreductase family protein  32.76 
 
 
250 aa  107  1e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2131  nitroreductase  29.69 
 
 
235 aa  106  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1195  nitroreductase  32.65 
 
 
256 aa  104  1e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.300642 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1558  nitroreductase  23.14 
 
 
287 aa  67.8  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000161675 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2590  nitroreductase  22.31 
 
 
287 aa  52.4  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000091924  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1206  hypothetical protein  23.74 
 
 
206 aa  47.8  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000154842  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1249  hypothetical protein  23.74 
 
 
206 aa  47.4  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3255  nitroreductase  22.17 
 
 
259 aa  45.4  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0694  hypothetical protein  21.14 
 
 
254 aa  44.3  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>