14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1195 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_1195  nitroreductase  100 
 
 		 256 aa  530  1e-150  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.300642 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23020  nitroreductase family protein  37.79 
 
 		 249 aa  159  4e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.373892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24230  nitroreductase family protein  40.07 
 
 		 250 aa  159  5e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0059  Nitroreductase  29.74 
 
 		 261 aa  106  3e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1360  hypothetical protein  29.8 
 
 		 235 aa  106  4e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06530  nitroreductase family protein  32.65 
 
 		 231 aa  104  1e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000696704  normal  0.412825 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2131  nitroreductase  29.46 
 
 		 235 aa  97.8  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2590  nitroreductase  26.74 
 
 		 287 aa  77  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000091924  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1558  nitroreductase  24.43 
 
 		 287 aa  63.5  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000161675 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf121  nitroreductase family protein  26.34 
 
 		 224 aa  62  0.000000009  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  29.57 
 
 		 163 aa  52.8  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0509  nitroreductase  26.37 
 
 		 181 aa  51.2  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3093  hypothetical protein  24.05 
 
 		 281 aa  43.1  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  28.23 
 
 		 176 aa  42.7  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>