16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1249 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_1206  hypothetical protein  99.03 
 
 
206 aa  424  1e-118  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000154842  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1249  hypothetical protein  100 
 
 
206 aa  426  1e-118  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0694  hypothetical protein  25.58 
 
 
254 aa  63.2  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2590  nitroreductase  24.4 
 
 
287 aa  62.8  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000091924  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3255  nitroreductase  25.55 
 
 
259 aa  62.4  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1598  nitroreductase  27.92 
 
 
224 aa  55.8  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23020  nitroreductase family protein  28.76 
 
 
249 aa  55.8  0.0000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.373892  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3093  hypothetical protein  24.28 
 
 
281 aa  55.5  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1558  nitroreductase  25.56 
 
 
287 aa  52.8  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000161675 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2131  nitroreductase  25.33 
 
 
235 aa  49.7  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24230  nitroreductase family protein  27.83 
 
 
250 aa  47.4  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06530  nitroreductase family protein  23.74 
 
 
231 aa  47.4  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000696704  normal  0.412825 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  23.26 
 
 
176 aa  44.7  0.0009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1360  hypothetical protein  28.64 
 
 
235 aa  43.5  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0059  Nitroreductase  29.75 
 
 
261 aa  43.1  0.003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf121  nitroreductase family protein  21.94 
 
 
224 aa  41.6  0.007  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>