24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_24230 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_24230  nitroreductase family protein  100 
 
 
250 aa  507  1e-143  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23020  nitroreductase family protein  48.61 
 
 
249 aa  225  5.0000000000000005e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.373892  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1195  nitroreductase  40.07 
 
 
256 aa  159  4e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.300642 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0059  Nitroreductase  31.27 
 
 
261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06530  nitroreductase family protein  32.76 
 
 
231 aa  107  1e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000696704  normal  0.412825 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2131  nitroreductase  33.99 
 
 
235 aa  108  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1360  hypothetical protein  33.2 
 
 
235 aa  103  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf121  nitroreductase family protein  26.12 
 
 
224 aa  84.7  0.000000000000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1558  nitroreductase  28.19 
 
 
287 aa  82  0.000000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000161675 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2590  nitroreductase  27.61 
 
 
287 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000091924  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3093  hypothetical protein  28.03 
 
 
281 aa  63.2  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  30.34 
 
 
190 aa  52.8  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  28.39 
 
 
176 aa  51.2  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  29.94 
 
 
170 aa  50.1  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1206  hypothetical protein  26.96 
 
 
206 aa  48.1  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000154842  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1249  hypothetical protein  27.83 
 
 
206 aa  47.4  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3255  nitroreductase  22.5 
 
 
259 aa  45.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  26.86 
 
 
192 aa  44.7  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1624  nitroreductase  26.7 
 
 
176 aa  43.9  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.101829  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  28.48 
 
 
163 aa  43.9  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3049  nitroreductase  25.48 
 
 
170 aa  44.3  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26390  nitroreductase  25.93 
 
 
174 aa  42.4  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0445  nitroreductase  27.61 
 
 
169 aa  42.4  0.007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.861043  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  34.38 
 
 
166 aa  42.4  0.008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>