44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1049 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_1049  hypothetical protein  100 
 
 
265 aa  535  1e-151  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1558  nitroreductase  24.91 
 
 
287 aa  75.1  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000161675 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2590  nitroreductase  24.03 
 
 
287 aa  72  0.000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000091924  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0694  hypothetical protein  25.97 
 
 
254 aa  53.9  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3255  nitroreductase  22.37 
 
 
259 aa  53.1  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  25 
 
 
166 aa  51.2  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3919  nitroreductase family protein  62.5 
 
 
197 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0470  nitroreductase  24.42 
 
 
171 aa  47.4  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3531  nitroreductase  51.43 
 
 
197 aa  47  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.12812  normal  0.174487 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0427  oxidoreductase  51.43 
 
 
205 aa  47  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0432  nitroreductase  51.43 
 
 
201 aa  47  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.181342  normal  0.330733 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0406  nitroreductase  51.43 
 
 
201 aa  47  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.699033  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1360  hypothetical protein  25.21 
 
 
235 aa  47  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2772  nitroreductase  35.19 
 
 
200 aa  46.6  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2131  nitroreductase  25 
 
 
235 aa  46.2  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0474  nitroreductase  51.43 
 
 
201 aa  46.2  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.573695 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3589  nitroreductase  51.43 
 
 
201 aa  46.2  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1571  nitroreductase  54.55 
 
 
199 aa  46.2  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.160224  normal  0.163104 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0501  nitroreductase  51.43 
 
 
201 aa  46.2  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2604  nitroreductase  51.43 
 
 
201 aa  46.2  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.759207  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0028  nitroreductase family protein  48.57 
 
 
201 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.901836  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2805  nitroreductase family protein  48.57 
 
 
201 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.360066  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1518  nitroreductase  25.5 
 
 
170 aa  44.7  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3612  nitroreductase family protein  48.57 
 
 
201 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2938  nitroreductase family protein  48.57 
 
 
201 aa  45.4  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3601  nitroreductase family protein  48.57 
 
 
201 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.735488  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3625  nitroreductase family protein  48.57 
 
 
201 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.159047  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1442  nitroreductase  44.44 
 
 
195 aa  44.3  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  39.13 
 
 
177 aa  44.3  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1738  nitroreductase family protein  48.57 
 
 
201 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3172  nitroreductase family protein  48.57 
 
 
201 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2896  nitroreductase  48.57 
 
 
207 aa  44.3  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.318005  normal  0.764115 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1566  nitroreductase  56.67 
 
 
197 aa  43.9  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00494476 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1625  nitroreductase  20.35 
 
 
176 aa  43.5  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0106837  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1391  nitroreductase  53.12 
 
 
197 aa  43.1  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2730  nitroreductase  45.71 
 
 
205 aa  42.7  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.796867  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3177  putative NADH dehydrogenase/NAD(P)H nitroreductase  33.33 
 
 
204 aa  42.7  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.999951  normal  0.135022 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0489  hypothetical protein  46.88 
 
 
271 aa  42.4  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.143021 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1624  molybdopterin biosynthesis protein MoeY  23.91 
 
 
369 aa  42.4  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00849574  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1558  hypothetical protein  28.83 
 
 
782 aa  42  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000244044 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23020  nitroreductase family protein  24.43 
 
 
249 aa  42  0.009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.373892  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  27.15 
 
 
170 aa  42  0.009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  40.54 
 
 
180 aa  42  0.01  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24750  nitroreductase  22.02 
 
 
176 aa  42  0.01  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>