19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_23020 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_23020  nitroreductase family protein  100 
 
 
249 aa  507  1e-143  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.373892  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24230  nitroreductase family protein  48.61 
 
 
250 aa  225  5.0000000000000005e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1195  nitroreductase  37.79 
 
 
256 aa  159  4e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.300642 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0059  Nitroreductase  34.48 
 
 
261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1360  hypothetical protein  32.11 
 
 
235 aa  115  6.9999999999999995e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2131  nitroreductase  33.47 
 
 
235 aa  112  6e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06530  nitroreductase family protein  30.34 
 
 
231 aa  109  3e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000696704  normal  0.412825 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1558  nitroreductase  30.19 
 
 
287 aa  95.9  6e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000161675 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2590  nitroreductase  27.07 
 
 
287 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000091924  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf121  nitroreductase family protein  25.64 
 
 
224 aa  75.5  0.0000000000007  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3093  hypothetical protein  26.36 
 
 
281 aa  68.2  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1206  hypothetical protein  29.18 
 
 
206 aa  56.2  0.0000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000154842  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1249  hypothetical protein  28.76 
 
 
206 aa  55.8  0.0000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  25.33 
 
 
170 aa  46.2  0.0005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  27.48 
 
 
163 aa  44.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  30.25 
 
 
174 aa  42.4  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0997  nitroreductase family protein  27.69 
 
 
181 aa  42.4  0.008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0119809  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1165  nitroreductase family protein  27.69 
 
 
181 aa  42.4  0.008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000313764  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1049  hypothetical protein  24.43 
 
 
265 aa  42  0.008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>