16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1758 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1758  hypothetical protein  100 
 
 
180 aa  354  3.9999999999999996e-97  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1284  hypothetical protein  60.92 
 
 
171 aa  194  8.000000000000001e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1753  YapH protein  42.54 
 
 
179 aa  104  8e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1286  YapH protein  39.76 
 
 
168 aa  80.5  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1288  YapH protein  37.84 
 
 
175 aa  78.6  0.00000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1292  hypothetical protein  31.82 
 
 
166 aa  74.7  0.0000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0495073  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2317  hypothetical protein  39.26 
 
 
186 aa  68.6  0.00000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.670509  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2974  hypothetical protein  33.14 
 
 
168 aa  64.7  0.0000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0717872 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10353  hypothetical protein  36.02 
 
 
180 aa  63.9  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5314  YapH protein  36.51 
 
 
163 aa  58.5  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.752271  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2858  hypothetical protein  40.32 
 
 
165 aa  58.2  0.00000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.347157 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1216  hypothetical protein  32.93 
 
 
175 aa  54.3  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0450  hypothetical protein  28.69 
 
 
158 aa  44.7  0.0007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000000742352  hitchhiker  0.00000000466691 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0451  hypothetical protein  41.51 
 
 
303 aa  42  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000221433  decreased coverage  0.000000000370346 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4914  YapH protein  32.26 
 
 
170 aa  41.2  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00218477  normal  0.159647 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06480  hypothetical protein  25.81 
 
 
144 aa  40.8  0.01  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>