17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4914 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4914  YapH protein  100 
 
 		 170 aa  320  5e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00218477  normal  0.159647 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1284  hypothetical protein  38.55 
 
 		 171 aa  79  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10353  hypothetical protein  40.37 
 
 		 180 aa  75.9  0.0000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1753  YapH protein  40.66 
 
 		 179 aa  71.2  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5314  YapH protein  44.85 
 
 		 163 aa  68.2  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.752271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1288  YapH protein  35.98 
 
 		 175 aa  62.8  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1212  hypothetical protein  36.43 
 
 		 329 aa  60.8  0.000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.733217  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2317  hypothetical protein  35.03 
 
 		 186 aa  60.5  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.670509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1286  YapH protein  40.77 
 
 		 168 aa  60.1  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1758  hypothetical protein  35.14 
 
 		 180 aa  58.2  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2858  hypothetical protein  39.71 
 
 		 165 aa  52.8  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.347157 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1216  hypothetical protein  29.11 
 
 		 175 aa  48.9  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0450  hypothetical protein  28.82 
 
 		 158 aa  47.8  0.00007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000000742352  hitchhiker  0.00000000466691 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2974  hypothetical protein  31.43 
 
 		 168 aa  46.2  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0717872 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0451  hypothetical protein  33.33 
 
 		 303 aa  45.4  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000221433  decreased coverage  0.000000000370346 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5312  hypothetical protein  32.75 
 
 		 183 aa  44.7  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.587987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1292  hypothetical protein  31.46 
 
 		 166 aa  43.9  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0495073  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>