13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2317 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2317  hypothetical protein  100 
 
 		 186 aa  369  1e-101  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.670509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1284  hypothetical protein  39.69 
 
 		 171 aa  77.8  0.00000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10353  hypothetical protein  34.18 
 
 		 180 aa  68.9  0.00000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1286  YapH protein  41.04 
 
 		 168 aa  68.6  0.00000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0450  hypothetical protein  31.15 
 
 		 158 aa  61.6  0.000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000000742352  hitchhiker  0.00000000466691 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1758  hypothetical protein  38.17 
 
 		 180 aa  61.2  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1753  YapH protein  39.55 
 
 		 179 aa  59.3  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2858  hypothetical protein  33.8 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.347157 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5314  YapH protein  31.72 
 
 		 163 aa  49.3  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.752271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0451  hypothetical protein  30.82 
 
 		 303 aa  48.9  0.00005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000221433  decreased coverage  0.000000000370346 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1292  hypothetical protein  28.57 
 
 		 166 aa  48.1  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0495073  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1212  hypothetical protein  33.33 
 
 		 329 aa  44.7  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.733217  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1288  YapH protein  31.58 
 
 		 175 aa  41.6  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>