15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2858 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2858  hypothetical protein  100 
 
 		 165 aa  312  9.999999999999999e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.347157 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1292  hypothetical protein  38.1 
 
 		 166 aa  72.4  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0495073  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10353  hypothetical protein  33.7 
 
 		 180 aa  68.2  0.00000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1286  YapH protein  40.15 
 
 		 168 aa  65.5  0.0000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2317  hypothetical protein  32.26 
 
 		 186 aa  62.8  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.670509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0450  hypothetical protein  32.92 
 
 		 158 aa  59.7  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000000742352  hitchhiker  0.00000000466691 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1284  hypothetical protein  35.39 
 
 		 171 aa  57.8  0.00000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1758  hypothetical protein  38.46 
 
 		 180 aa  52.8  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4914  YapH protein  38.24 
 
 		 170 aa  50.8  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00218477  normal  0.159647 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1216  hypothetical protein  32.24 
 
 		 175 aa  50.1  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1753  YapH protein  32.61 
 
 		 179 aa  48.9  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1288  YapH protein  34.66 
 
 		 175 aa  48.9  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0451  hypothetical protein  30.23 
 
 		 303 aa  47.8  0.00006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000221433  decreased coverage  0.000000000370346 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5314  YapH protein  32.58 
 
 		 163 aa  42.4  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.752271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06479  hypothetical protein  34.27 
 
 		 144 aa  42.7  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>