14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_10353 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_10353  hypothetical protein  100 
 
 
180 aa  343  1e-93  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2317  hypothetical protein  33.67 
 
 
186 aa  65.5  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.670509  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1284  hypothetical protein  35.52 
 
 
171 aa  64.3  0.0000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0451  hypothetical protein  36 
 
 
303 aa  61.2  0.000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000221433  decreased coverage  0.000000000370346 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2858  hypothetical protein  32.87 
 
 
165 aa  60.1  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.347157 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1758  hypothetical protein  36.6 
 
 
180 aa  59.3  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1753  YapH protein  37.18 
 
 
179 aa  58.9  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1286  YapH protein  36.76 
 
 
168 aa  54.3  0.0000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1288  YapH protein  33.75 
 
 
175 aa  54.7  0.0000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1216  hypothetical protein  30.91 
 
 
175 aa  54.3  0.0000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1212  hypothetical protein  35.77 
 
 
329 aa  52.8  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.733217  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1292  hypothetical protein  33.33 
 
 
166 aa  50.1  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0495073  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5314  YapH protein  30.77 
 
 
163 aa  47.4  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.752271  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4914  YapH protein  36.65 
 
 
170 aa  47  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00218477  normal  0.159647 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>