35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2247 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_2247  Methyltransferase type 11  100 
 
 
210 aa  424  1e-118  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0526  Methyltransferase type 11  61.72 
 
 
215 aa  273  2.0000000000000002e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3789  methyltransferase type 12  33.66 
 
 
209 aa  111  9e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.326438 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3662  methyltransferase  33.33 
 
 
212 aa  102  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.498746  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3720  Methyltransferase type 12  32.38 
 
 
212 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.176798  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3803  Methyltransferase type 12  32.38 
 
 
212 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2402  Methyltransferase type 11  26.11 
 
 
159 aa  65.1  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2754  biotin biosynthesis protein BioC  33.04 
 
 
272 aa  52.4  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.32969  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9102  hypothetical protein  39.81 
 
 
268 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3543  transcriptional regulator, ArsR family  25.77 
 
 
335 aa  46.2  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1849  methyltransferase type 11  28.17 
 
 
259 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2320  methyltransferase type 11  31.07 
 
 
205 aa  45.8  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.107701  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1899  Methyltransferase type 11  30.65 
 
 
266 aa  45.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0163347  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2273  methyltransferase type 11  31.63 
 
 
204 aa  45.8  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.972016  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2345  methyltransferase type 11  31.31 
 
 
204 aa  45.8  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2422  Methyltransferase type 11  26.32 
 
 
232 aa  45.1  0.0008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2595  methyltransferase type 11  30.3 
 
 
204 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.133869  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  34.86 
 
 
251 aa  44.3  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1751  Methyltransferase type 11  30.61 
 
 
204 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.190561  hitchhiker  0.00369788 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  23.53 
 
 
211 aa  44.3  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2634  methyltransferase type 11  30.3 
 
 
204 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.162625  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3351  methyltransferase type 11  33.01 
 
 
257 aa  44.7  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2709  methyltransferase type 11  30.3 
 
 
204 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.690891  normal  0.954825 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2463  methyltransferase type 11  30.3 
 
 
204 aa  43.5  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.899692  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2136  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.34 
 
 
256 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000208135  decreased coverage  0.00294275 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  28.15 
 
 
252 aa  43.1  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0084  methyltransferase type 11  25.34 
 
 
208 aa  42.7  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.559166  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0252  Methyltransferase type 12  32.03 
 
 
227 aa  42.7  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.965523  hitchhiker  0.00106675 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5925  Methyltransferase type 11  28.77 
 
 
258 aa  42.7  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1280  Methyltransferase type 11  27.82 
 
 
204 aa  42.4  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0785  methyltransferase type 11  31.13 
 
 
267 aa  42  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1433  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.43 
 
 
259 aa  41.6  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0953  arsenite S-adenosylmethyltransferase  30.3 
 
 
265 aa  41.6  0.008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000240908  hitchhiker  0.000000043462 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2291  hypothetical protein  35.14 
 
 
263 aa  41.6  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05540  ArsR family regulatory protein  29.81 
 
 
336 aa  41.6  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>