39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1583 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_1583  hypothetical protein  100 
 
 
131 aa  262  1e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.228645 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1271  hypothetical protein  63.91 
 
 
134 aa  130  5e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0708152  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22900  hypothetical protein  60.58 
 
 
135 aa  130  7.999999999999999e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0379071 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1064  hypothetical protein  45.11 
 
 
131 aa  114  3e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.264456  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3212  hypothetical protein  50.39 
 
 
130 aa  113  7.999999999999999e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0878048  normal  0.0167489 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1561  membrane protein  44.62 
 
 
124 aa  102  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2656  hypothetical protein  43.88 
 
 
137 aa  95.1  3e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.45756  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1560  membrane protein  42.22 
 
 
123 aa  89  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.354904  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2423  hypothetical protein  51.14 
 
 
128 aa  87  8e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0727149 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0883  hypothetical protein  35.97 
 
 
136 aa  83.2  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10710  hypothetical protein  38.52 
 
 
136 aa  79.3  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00294922  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1097  hypothetical protein  33.85 
 
 
125 aa  78.6  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1648  hypothetical protein  40.44 
 
 
138 aa  77  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.453573 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3266  putative transmembrane protein  36.23 
 
 
136 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3277  putative transmembrane protein  36.23 
 
 
136 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.923465 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3328  putative transmembrane protein  36.23 
 
 
136 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.125579 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3533  putative transmembrane protein  38.13 
 
 
134 aa  73.9  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.051598  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2978  putative transmembrane protein  39.26 
 
 
133 aa  72.8  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.188869  normal  0.698485 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0997  hypothetical protein  43.85 
 
 
123 aa  73.2  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.365631 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4921  hypothetical protein  38.1 
 
 
134 aa  72.4  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.028109 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2857  hypothetical protein  42.35 
 
 
132 aa  71.2  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.311607  normal  0.315018 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12197  transmembrane protein  36.09 
 
 
134 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3276  putative transmembrane protein  37.04 
 
 
138 aa  67  0.00000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5779  hypothetical protein  35.82 
 
 
128 aa  66.6  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000546753  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13700  hypothetical protein  43.61 
 
 
128 aa  66.2  0.0000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.588168  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1394  hypothetical protein  36.8 
 
 
127 aa  58.5  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0233371  hitchhiker  0.00692723 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3939  hypothetical protein  40.22 
 
 
126 aa  58.2  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.638034  normal  0.356234 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25060  hypothetical protein  38.89 
 
 
138 aa  55.8  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3027  hypothetical protein  37.88 
 
 
132 aa  55.5  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0335195  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0410  hypothetical protein  34.88 
 
 
95 aa  54.3  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2590  hypothetical protein  38.54 
 
 
97 aa  53.9  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000130432  hitchhiker  0.00139285 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3456  membrane protein  35.8 
 
 
105 aa  52  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3461  hypothetical protein  37.69 
 
 
131 aa  50.4  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00244455 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2939  hypothetical protein  31.46 
 
 
134 aa  50.1  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000333137  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5111  hypothetical protein  40.16 
 
 
140 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.435647  normal  0.426804 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3235  hypothetical protein  36.15 
 
 
131 aa  48.9  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00764978 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0682  hypothetical protein  32.93 
 
 
118 aa  46.6  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1402  hypothetical protein  52.38 
 
 
136 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.174995  hitchhiker  0.00176576 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5080  hypothetical protein  36.36 
 
 
91 aa  40.4  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.472401 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>