39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3235 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3235  hypothetical protein  100 
 
 		 131 aa  258  2e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00764978 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3461  hypothetical protein  96.95 
 
 		 131 aa  184  3e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244455 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1097  hypothetical protein  45.11 
 
 		 125 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0883  hypothetical protein  40.74 
 
 		 136 aa  103  5e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2857  hypothetical protein  49.57 
 
 		 132 aa  99.4  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.311607  normal  0.315018 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4921  hypothetical protein  47.01 
 
 		 134 aa  94.7  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.028109 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3266  putative transmembrane protein  45.19 
 
 		 136 aa  92.8  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3328  putative transmembrane protein  45.19 
 
 		 136 aa  92.8  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.125579 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3277  putative transmembrane protein  45.19 
 
 		 136 aa  92.8  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.923465 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3212  hypothetical protein  45.67 
 
 		 130 aa  91.7  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0878048  normal  0.0167489 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1648  hypothetical protein  43.8 
 
 		 138 aa  90.1  9e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.453573 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3533  putative transmembrane protein  42.54 
 
 		 134 aa  86.7  9e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.051598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12197  transmembrane protein  42.54 
 
 		 134 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3276  putative transmembrane protein  40.74 
 
 		 138 aa  84.7  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1394  hypothetical protein  53.1 
 
 		 127 aa  84  7e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0233371  hitchhiker  0.00692723 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5779  hypothetical protein  40.58 
 
 		 128 aa  82.8  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000546753  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2978  putative transmembrane protein  41.35 
 
 		 133 aa  80.1  0.000000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.188869  normal  0.698485 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2656  hypothetical protein  42.22 
 
 		 137 aa  79.3  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.45756  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2939  hypothetical protein  45.53 
 
 		 134 aa  79.7  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000333137  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1064  hypothetical protein  35.29 
 
 		 131 aa  73.2  0.000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.264456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25060  hypothetical protein  46.67 
 
 		 138 aa  67.4  0.00000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1561  membrane protein  31.3 
 
 		 124 aa  66.2  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22900  hypothetical protein  38.06 
 
 		 135 aa  66.6  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0379071 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0997  hypothetical protein  40 
 
 		 123 aa  66.2  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.365631 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5111  hypothetical protein  43.59 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.435647  normal  0.426804 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3939  hypothetical protein  45.1 
 
 		 126 aa  62.8  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.638034  normal  0.356234 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10710  hypothetical protein  34.11 
 
 		 136 aa  62  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00294922  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1402  hypothetical protein  48.21 
 
 		 136 aa  61.2  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.174995  hitchhiker  0.00176576 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1560  membrane protein  33.59 
 
 		 123 aa  56.6  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.354904  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3456  membrane protein  41.03 
 
 		 105 aa  55.1  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0682  hypothetical protein  42.31 
 
 		 118 aa  53.1  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1271  hypothetical protein  36.03 
 
 		 134 aa  52  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0708152  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2423  hypothetical protein  36.78 
 
 		 128 aa  51.6  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0727149 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0410  hypothetical protein  36.05 
 
 		 95 aa  50.1  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3027  hypothetical protein  37.23 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0335195  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2590  hypothetical protein  37.18 
 
 		 97 aa  45.4  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000130432  hitchhiker  0.00139285 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3000  hypothetical protein  43.37 
 
 		 92 aa  45.4  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00147216  decreased coverage  0.000036152 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3076  hypothetical protein  43.09 
 
 		 153 aa  45.4  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.329637  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1738  hypothetical protein  26.92 
 
 		 133 aa  41.6  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00377862  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>