36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_10710 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_10710  hypothetical protein  100 
 
 		 136 aa  268  1e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00294922  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3212  hypothetical protein  44.44 
 
 		 130 aa  108  4.0000000000000004e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0878048  normal  0.0167489 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1064  hypothetical protein  38.64 
 
 		 131 aa  95.1  3e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.264456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1561  membrane protein  38.06 
 
 		 124 aa  92.4  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3277  putative transmembrane protein  39.26 
 
 		 136 aa  82.8  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.923465 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3328  putative transmembrane protein  39.26 
 
 		 136 aa  82.8  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.125579 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3266  putative transmembrane protein  39.26 
 
 		 136 aa  82.8  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3533  putative transmembrane protein  38.85 
 
 		 134 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.051598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12197  transmembrane protein  37.59 
 
 		 134 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2423  hypothetical protein  48.28 
 
 		 128 aa  77.8  0.00000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0727149 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2978  putative transmembrane protein  37.04 
 
 		 133 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.188869  normal  0.698485 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22900  hypothetical protein  39.42 
 
 		 135 aa  75.1  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0379071 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1560  membrane protein  38.06 
 
 		 123 aa  75.1  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.354904  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5779  hypothetical protein  36.84 
 
 		 128 aa  74.3  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000546753  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1271  hypothetical protein  39.85 
 
 		 134 aa  65.1  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0708152  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4921  hypothetical protein  46.99 
 
 		 134 aa  65.1  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.028109 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0883  hypothetical protein  32.85 
 
 		 136 aa  63.9  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25060  hypothetical protein  39.81 
 
 		 138 aa  63.9  0.0000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13700  hypothetical protein  43.28 
 
 		 128 aa  62.8  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.588168  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1648  hypothetical protein  32.14 
 
 		 138 aa  62  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.453573 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1097  hypothetical protein  31.85 
 
 		 125 aa  61.6  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2656  hypothetical protein  33.57 
 
 		 137 aa  60.8  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.45756  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2857  hypothetical protein  35.63 
 
 		 132 aa  60.1  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.311607  normal  0.315018 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3027  hypothetical protein  37.41 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0335195  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3276  putative transmembrane protein  38.24 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3456  membrane protein  39.29 
 
 		 105 aa  58.9  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3939  hypothetical protein  47.37 
 
 		 126 aa  53.5  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.638034  normal  0.356234 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1394  hypothetical protein  38.89 
 
 		 127 aa  52.4  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0233371  hitchhiker  0.00692723 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1583  hypothetical protein  37.04 
 
 		 131 aa  51.6  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.228645 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0997  hypothetical protein  34.33 
 
 		 123 aa  51.6  0.000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.365631 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0682  hypothetical protein  32.5 
 
 		 118 aa  49.3  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2939  hypothetical protein  36.26 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000333137  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5111  hypothetical protein  35.29 
 
 		 140 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.435647  normal  0.426804 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20730  hypothetical protein  38.98 
 
 		 114 aa  43.9  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0842566  normal  0.0930526 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1402  hypothetical protein  35.4 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.174995  hitchhiker  0.00176576 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2590  hypothetical protein  28.74 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000130432  hitchhiker  0.00139285 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>