34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0682 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_0682  hypothetical protein  100 
 
 
118 aa  238  2e-62  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3212  hypothetical protein  46.99 
 
 
130 aa  65.1  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0878048  normal  0.0167489 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3276  putative transmembrane protein  46.15 
 
 
138 aa  62  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2857  hypothetical protein  33.93 
 
 
132 aa  57  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.311607  normal  0.315018 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1097  hypothetical protein  41.25 
 
 
125 aa  57  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3266  putative transmembrane protein  38.1 
 
 
136 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3328  putative transmembrane protein  38.1 
 
 
136 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.125579 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3277  putative transmembrane protein  38.1 
 
 
136 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.923465 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5111  hypothetical protein  39.13 
 
 
140 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.435647  normal  0.426804 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0883  hypothetical protein  38.75 
 
 
136 aa  54.3  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2978  putative transmembrane protein  36.9 
 
 
133 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.188869  normal  0.698485 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2656  hypothetical protein  39.02 
 
 
137 aa  53.9  0.0000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.45756  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5779  hypothetical protein  36.71 
 
 
128 aa  53.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000546753  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25060  hypothetical protein  40 
 
 
138 aa  52.8  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3533  putative transmembrane protein  36.9 
 
 
134 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.051598  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1561  membrane protein  30 
 
 
124 aa  52  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3939  hypothetical protein  41.18 
 
 
126 aa  50.8  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.638034  normal  0.356234 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1394  hypothetical protein  32.11 
 
 
127 aa  50.4  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0233371  hitchhiker  0.00692723 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1648  hypothetical protein  32.58 
 
 
138 aa  50.8  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.453573 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1402  hypothetical protein  39.78 
 
 
136 aa  50.4  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.174995  hitchhiker  0.00176576 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1560  membrane protein  27.27 
 
 
123 aa  50.1  0.000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.354904  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3027  hypothetical protein  39.29 
 
 
132 aa  50.1  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0335195  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2590  hypothetical protein  37.97 
 
 
97 aa  49.3  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000130432  hitchhiker  0.00139285 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0410  hypothetical protein  34.09 
 
 
95 aa  48.5  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10710  hypothetical protein  35.29 
 
 
136 aa  48.1  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00294922  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1064  hypothetical protein  35.63 
 
 
131 aa  47.8  0.00005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.264456  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12197  transmembrane protein  34.52 
 
 
134 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2939  hypothetical protein  36.25 
 
 
134 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000333137  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4921  hypothetical protein  36.44 
 
 
134 aa  46.6  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.028109 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1738  hypothetical protein  31.25 
 
 
133 aa  45.4  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00377862  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0997  hypothetical protein  37.21 
 
 
123 aa  43.9  0.0008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.365631 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1271  hypothetical protein  33.33 
 
 
134 aa  43.5  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0708152  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22900  hypothetical protein  32.22 
 
 
135 aa  42.4  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0379071 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3456  membrane protein  32.05 
 
 
105 aa  42.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>