42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_3277 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3266  putative transmembrane protein  100 
 
 
136 aa  265  2e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3277  putative transmembrane protein  100 
 
 
136 aa  265  2e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.923465 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3328  putative transmembrane protein  100 
 
 
136 aa  265  2e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.125579 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3533  putative transmembrane protein  86.76 
 
 
134 aa  219  8e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.051598  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12197  transmembrane protein  80.88 
 
 
134 aa  212  9.999999999999999e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2978  putative transmembrane protein  81.62 
 
 
133 aa  212  9.999999999999999e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.188869  normal  0.698485 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5779  hypothetical protein  51.11 
 
 
128 aa  130  6.999999999999999e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000546753  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2656  hypothetical protein  48.57 
 
 
137 aa  116  7.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.45756  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25060  hypothetical protein  61.9 
 
 
138 aa  110  8.000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3027  hypothetical protein  52.48 
 
 
132 aa  107  4.0000000000000004e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0335195  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1097  hypothetical protein  41.35 
 
 
125 aa  92.8  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3276  putative transmembrane protein  44.9 
 
 
138 aa  90.9  5e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0883  hypothetical protein  42.45 
 
 
136 aa  90.5  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3212  hypothetical protein  44.03 
 
 
130 aa  90.9  6e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0878048  normal  0.0167489 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1648  hypothetical protein  41.89 
 
 
138 aa  87.8  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.453573 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2857  hypothetical protein  43.3 
 
 
132 aa  81.3  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.311607  normal  0.315018 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3939  hypothetical protein  48.57 
 
 
126 aa  79.7  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.638034  normal  0.356234 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1064  hypothetical protein  39.01 
 
 
131 aa  78.2  0.00000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.264456  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22900  hypothetical protein  34.48 
 
 
135 aa  77.8  0.00000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0379071 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1561  membrane protein  37.31 
 
 
124 aa  76.6  0.00000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10710  hypothetical protein  39.26 
 
 
136 aa  75.9  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00294922  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2423  hypothetical protein  45.16 
 
 
128 aa  71.6  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0727149 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4921  hypothetical protein  40.8 
 
 
134 aa  69.7  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.028109 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2939  hypothetical protein  42.61 
 
 
134 aa  69.7  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000333137  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1394  hypothetical protein  39.32 
 
 
127 aa  68.9  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0233371  hitchhiker  0.00692723 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1560  membrane protein  37.59 
 
 
123 aa  66.6  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.354904  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3235  hypothetical protein  42.86 
 
 
131 aa  63.2  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00764978 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3461  hypothetical protein  41.35 
 
 
131 aa  62.8  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00244455 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13700  hypothetical protein  35.04 
 
 
128 aa  60.8  0.000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.588168  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0410  hypothetical protein  37.04 
 
 
95 aa  59.7  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1271  hypothetical protein  35 
 
 
134 aa  57.8  0.00000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0708152  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0682  hypothetical protein  38.1 
 
 
118 aa  56.2  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5111  hypothetical protein  40.94 
 
 
140 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.435647  normal  0.426804 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0997  hypothetical protein  34.33 
 
 
123 aa  56.6  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.365631 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1402  hypothetical protein  40.5 
 
 
136 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.174995  hitchhiker  0.00176576 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3456  membrane protein  34.07 
 
 
105 aa  52.4  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1738  hypothetical protein  31.87 
 
 
133 aa  50.4  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00377862  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3646  hypothetical protein  34.41 
 
 
122 aa  50.4  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000185355  normal  0.0296142 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2590  hypothetical protein  33.7 
 
 
97 aa  49.7  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000130432  hitchhiker  0.00139285 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3000  hypothetical protein  42.86 
 
 
92 aa  48.1  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00147216  decreased coverage  0.000036152 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20730  hypothetical protein  31.18 
 
 
114 aa  43.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0842566  normal  0.0930526 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3076  hypothetical protein  39.78 
 
 
153 aa  41.2  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.329637  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>