43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1402 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1402  hypothetical protein  100 
 
 		 136 aa  266  8e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.174995  hitchhiker  0.00176576 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5111  hypothetical protein  79.53 
 
 		 140 aa  154  4e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.435647  normal  0.426804 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1097  hypothetical protein  46.62 
 
 		 125 aa  107  4.0000000000000004e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0883  hypothetical protein  42.86 
 
 		 136 aa  107  5e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5779  hypothetical protein  44.2 
 
 		 128 aa  102  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000546753  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2857  hypothetical protein  45.76 
 
 		 132 aa  101  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.311607  normal  0.315018 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1648  hypothetical protein  42.65 
 
 		 138 aa  92.8  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.453573 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3266  putative transmembrane protein  39.71 
 
 		 136 aa  90.5  7e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3328  putative transmembrane protein  39.71 
 
 		 136 aa  90.5  7e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.125579 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3277  putative transmembrane protein  39.71 
 
 		 136 aa  90.5  7e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.923465 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3276  putative transmembrane protein  43.36 
 
 		 138 aa  89.4  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2656  hypothetical protein  40.58 
 
 		 137 aa  87  7e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.45756  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12197  transmembrane protein  39.86 
 
 		 134 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1561  membrane protein  35.71 
 
 		 124 aa  85.1  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3533  putative transmembrane protein  40.29 
 
 		 134 aa  84.3  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.051598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2939  hypothetical protein  45.92 
 
 		 134 aa  84  7e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000333137  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3212  hypothetical protein  40.74 
 
 		 130 aa  82  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0878048  normal  0.0167489 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0997  hypothetical protein  47.76 
 
 		 123 aa  82.4  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.365631 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2978  putative transmembrane protein  38.69 
 
 		 133 aa  81.3  0.000000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.188869  normal  0.698485 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1394  hypothetical protein  48.42 
 
 		 127 aa  80.5  0.000000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0233371  hitchhiker  0.00692723 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4921  hypothetical protein  41.23 
 
 		 134 aa  74.7  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.028109 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1560  membrane protein  34.81 
 
 		 123 aa  72.4  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.354904  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3461  hypothetical protein  44.44 
 
 		 131 aa  72.4  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244455 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3235  hypothetical protein  42.86 
 
 		 131 aa  70.1  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00764978 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22900  hypothetical protein  34.72 
 
 		 135 aa  68.6  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0379071 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25060  hypothetical protein  50.59 
 
 		 138 aa  67.4  0.00000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3027  hypothetical protein  38.52 
 
 		 132 aa  67  0.00000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0335195  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1064  hypothetical protein  34.29 
 
 		 131 aa  65.5  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.264456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0682  hypothetical protein  39.78 
 
 		 118 aa  64.3  0.0000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3939  hypothetical protein  47.83 
 
 		 126 aa  62  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.638034  normal  0.356234 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10710  hypothetical protein  34.78 
 
 		 136 aa  61.6  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00294922  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2590  hypothetical protein  44.19 
 
 		 97 aa  60.5  0.000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000130432  hitchhiker  0.00139285 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1271  hypothetical protein  35.97 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0708152  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2423  hypothetical protein  41.67 
 
 		 128 aa  55.5  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0727149 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0410  hypothetical protein  39.51 
 
 		 95 aa  55.1  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3456  membrane protein  37.5 
 
 		 105 aa  53.1  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3076  hypothetical protein  53.01 
 
 		 153 aa  51.2  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.329637  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1738  hypothetical protein  34.94 
 
 		 133 aa  48.1  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00377862  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3000  hypothetical protein  40.26 
 
 		 92 aa  44.7  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00147216  decreased coverage  0.000036152 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1583  hypothetical protein  65.52 
 
 		 131 aa  43.9  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.228645 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3646  hypothetical protein  26.42 
 
 		 122 aa  42.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000185355  normal  0.0296142 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5080  hypothetical protein  40.62 
 
 		 91 aa  42  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.472401 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0476  putative integral membrane protein  33.33 
 
 		 99 aa  42  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>