20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_5080 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_5080  hypothetical protein  100 
 
 		 91 aa  173  7e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.472401 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2590  hypothetical protein  45.56 
 
 		 97 aa  66.6  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000130432  hitchhiker  0.00139285 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0410  hypothetical protein  38.96 
 
 		 95 aa  53.5  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2423  hypothetical protein  36.47 
 
 		 128 aa  50.1  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0727149 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3939  hypothetical protein  40.32 
 
 		 126 aa  48.5  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.638034  normal  0.356234 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1648  hypothetical protein  34.44 
 
 		 138 aa  47  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.453573 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3212  hypothetical protein  34.15 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0878048  normal  0.0167489 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2857  hypothetical protein  36.14 
 
 		 132 aa  45.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.311607  normal  0.315018 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3000  hypothetical protein  38.82 
 
 		 92 aa  45.4  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00147216  decreased coverage  0.000036152 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1738  hypothetical protein  36.9 
 
 		 133 aa  44.3  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00377862  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2978  putative transmembrane protein  34.52 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.188869  normal  0.698485 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0883  hypothetical protein  42.19 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12197  transmembrane protein  35.79 
 
 		 134 aa  41.6  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3276  putative transmembrane protein  38.27 
 
 		 138 aa  41.2  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0476  putative integral membrane protein  32.88 
 
 		 99 aa  40.8  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3277  putative transmembrane protein  32.63 
 
 		 136 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.923465 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3533  putative transmembrane protein  34.52 
 
 		 134 aa  40.4  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.051598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3328  putative transmembrane protein  32.63 
 
 		 136 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.125579 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3266  putative transmembrane protein  32.63 
 
 		 136 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0997  hypothetical protein  38.82 
 
 		 123 aa  40  0.01  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.365631 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>