20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3000 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3000  hypothetical protein  100 
 
 		 92 aa  173  8e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00147216  decreased coverage  0.000036152 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2590  hypothetical protein  45.65 
 
 		 97 aa  75.5  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000130432  hitchhiker  0.00139285 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0410  hypothetical protein  38.95 
 
 		 95 aa  63.2  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3939  hypothetical protein  48.39 
 
 		 126 aa  57.8  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.638034  normal  0.356234 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12197  transmembrane protein  36.47 
 
 		 134 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5779  hypothetical protein  42.19 
 
 		 128 aa  52  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000546753  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0883  hypothetical protein  45.31 
 
 		 136 aa  50.4  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2978  putative transmembrane protein  42.86 
 
 		 133 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.188869  normal  0.698485 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3533  putative transmembrane protein  42.86 
 
 		 134 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.051598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1648  hypothetical protein  35.58 
 
 		 138 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.453573 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2857  hypothetical protein  41.89 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.311607  normal  0.315018 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3277  putative transmembrane protein  42.86 
 
 		 136 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.923465 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3328  putative transmembrane protein  42.86 
 
 		 136 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.125579 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3266  putative transmembrane protein  42.86 
 
 		 136 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3646  hypothetical protein  39.53 
 
 		 122 aa  47.4  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000185355  normal  0.0296142 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3276  putative transmembrane protein  40 
 
 		 138 aa  47  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2656  hypothetical protein  40 
 
 		 137 aa  43.9  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.45756  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1097  hypothetical protein  42.86 
 
 		 125 aa  43.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5080  hypothetical protein  38.89 
 
 		 91 aa  41.2  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.472401 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25060  hypothetical protein  43.33 
 
 		 138 aa  40.8  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>