29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3646 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3646  hypothetical protein  100 
 
 		 122 aa  245  2e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000185355  normal  0.0296142 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5779  hypothetical protein  39.78 
 
 		 128 aa  64.7  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000546753  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3533  putative transmembrane protein  34.88 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.051598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3328  putative transmembrane protein  37.5 
 
 		 136 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.125579 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3277  putative transmembrane protein  37.5 
 
 		 136 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.923465 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3939  hypothetical protein  42.05 
 
 		 126 aa  58.5  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.638034  normal  0.356234 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3266  putative transmembrane protein  37.5 
 
 		 136 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2978  putative transmembrane protein  39.58 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.188869  normal  0.698485 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12197  transmembrane protein  36.08 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3000  hypothetical protein  39.53 
 
 		 92 aa  53.9  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00147216  decreased coverage  0.000036152 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2656  hypothetical protein  37.36 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.45756  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1648  hypothetical protein  31.82 
 
 		 138 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.453573 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3276  putative transmembrane protein  32.98 
 
 		 138 aa  49.7  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1064  hypothetical protein  30.6 
 
 		 131 aa  49.3  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.264456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2857  hypothetical protein  38.37 
 
 		 132 aa  47.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.311607  normal  0.315018 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0410  hypothetical protein  32.1 
 
 		 95 aa  47.8  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25060  hypothetical protein  33.67 
 
 		 138 aa  46.2  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0883  hypothetical protein  35.96 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10710  hypothetical protein  36.71 
 
 		 136 aa  45.4  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00294922  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2590  hypothetical protein  35.63 
 
 		 97 aa  44.7  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000130432  hitchhiker  0.00139285 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3212  hypothetical protein  36.78 
 
 		 130 aa  43.9  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0878048  normal  0.0167489 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2423  hypothetical protein  32.22 
 
 		 128 aa  43.9  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0727149 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1561  membrane protein  29.41 
 
 		 124 aa  43.9  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5080  hypothetical protein  32.26 
 
 		 91 aa  41.2  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.472401 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3027  hypothetical protein  30.71 
 
 		 132 aa  41.2  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0335195  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4921  hypothetical protein  31.82 
 
 		 134 aa  41.2  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.028109 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3456  membrane protein  32.22 
 
 		 105 aa  41.2  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13700  hypothetical protein  29.03 
 
 		 128 aa  40.4  0.008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.588168  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2939  hypothetical protein  33.91 
 
 		 134 aa  40.4  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000333137  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>